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 詳細要約
  Cell Type-Specific Gene Expression Profiling Using Fluorescence-Activated Nuclear Sorting

Slane, D., & Bayer, M. (2017). Cell Type-Specific Gene Expression Profiling Using Fluorescence-Activated Nuclear Sorting. In Methods in Molecular Biology (pp. 27-35). Berlin: Springer.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-132D-7 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-1AAA-2
資料種別: 書籍の一部

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URL:
https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-7125-1_3 (出版社版)
説明:
-
OA-Status:

作成者

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 作成者:
Slane, Daniel1, 著者
Bayer, Martin1, 著者
所属:
1Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, Max-Planck-Ring 5, 72076 Tübingen, DE, ou_2421691              

内容説明

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キーワード: FACS; FANS; Cell type; mRNA; RNA amplification; Nuclear transcriptome; Microarray
 要旨: Fluorescence-activated cell sorting (FACS) is a powerful method for the analysis of cell type-specific transcriptome profiles, DNA or histone modifications, and chemical compounds. In plants, it has been employed mainly with root and shoot tissue in combination with cell wall digestion on cellular and nuclear content. However, many tissues are recalcitrant to cell separation and are therefore not readily accessible for FACS analysis. Here, we lay out a detailed protocol for the generation of transcriptional profiles from fluorescently labeled nuclei. The protocol described in this chapter has been used successfully to generate a transcriptional map of the early Arabidopsis thaliana embryo.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2017-06-172017
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: -
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Methods in Molecular Biology
種別: 複数巻
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Berlin : Springer
ページ: - 巻号: Plant Gene Regulatory Networks: Methods and Protocols 通巻号: - 開始・終了ページ: 27 - 35 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -