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  Comparative genomics of the major parasitic worms

Coghlan, A., Tyagi, R., Cotton, J. A., Holroyd, N., Rosa, B. A., Tsai, I. J., et al. (2018). Comparative genomics of the major parasitic worms. Nature Genetics, 51, 163-174. doi:10.1038/s41588-018-0262-1.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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s41588-018-0262-1.pdf (Verlagsversion), 3MB
Name:
s41588-018-0262-1.pdf
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-
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Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
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Externe Referenzen

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externe Referenz:
https://www.nature.com/articles/s41588-018-0262-1 (Verlagsversion)
Beschreibung:
-
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Urheber

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 Urheber:
Coghlan, Avril, Autor
Tyagi, Rahul, Autor
Cotton, James A., Autor
Holroyd, Nancy, Autor
Rosa, Bruce A., Autor
Tsai, Isheng Jason, Autor
Laetsch, Dominik R., Autor
Beech, Robin N., Autor
Day, Tim A., Autor
Hallsworth-Pepin, Kymberlie, Autor
Ke, Huei-Mien, Autor
Kuo, Tzu-Hao, Autor
Lee, Tracy J., Autor
Martin, John, Autor
Maizels, Rick M., Autor
Mutowo, Prudence, Autor
Ozersky, Philip, Autor
Parkinson, John, Autor
Reid, Adam J., Autor
Rawlings, Neil D., Autor
Ribeiro, Diogo M., AutorSwapna, Lakshmipuram Seshadri, AutorStanley, Eleanor, AutorTaylor, David W., AutorWheeler, Nicolas J., AutorZamanian, Mostafa, AutorZhang, Xu1, 2, Autor           Allan, Fiona, AutorAllen, Judith E., AutorAsano, Kazuhito, AutorBabayan, Simon A., AutorBah, Germanus, AutorBeasley, Helen, AutorBennett, Hayley M., AutorBisset, Stewart A., AutorCastillo, Estela, AutorCook, Joseph, AutorCooper, Philip J., AutorCruz-Bustos, Teresa, AutorCuéllar, Carmen, AutorDevaney, Eileen, AutorDoyle, Stephen R., AutorEberhard, Mark L., AutorEmery, Aidan, AutorEom, Keeseon S., AutorGilleard, John S., AutorGordon, Daria, AutorHarcus, Yvonne, AutorHarsha, Bhavana, AutorHawdon, John M., AutorHill, Dolores E., AutorHodgkinson, Jane, AutorHorák, Petr, AutorHowe, Kevin L., AutorHuckvale, Thomas, AutorKalbe, Martin3, 4, Autor           Kaur, Gaganjot, AutorKikuchi, Taisei, AutorKoutsovoulos, Georgios, AutorKumar, Sujai, AutorLeach, Andrew R., AutorLomax, Jane, AutorMakepeace, Benjamin, AutorMatthews, Jacqueline B., AutorMuro, Antonio, AutorO’Boyle, Noel Michael, AutorOlson, Peter D., AutorOsuna, Antonio, AutorPartono, Felix, AutorPfarr, Kenneth, AutorRinaldi, Gabriel, AutorForonda, Pilar, AutorRollinson, David, AutorSamblas, Mercedes Gomez, AutorSato, Hiroshi, AutorSchnyder, Manuela, AutorScholz, Tomáš, AutorShafie, Myriam, AutorTanya, Vincent N., AutorToledo, Rafael, AutorTracey, Alan, AutorUrban, Joseph F., AutorWang, Lian-Chen, AutorZarlenga, Dante, AutorBlaxter, Mark L., AutorMitreva, Makedonka, AutorBerriman, Matthew, AutorConsortium, International Helminth Genomes, Autor mehr..
Affiliations:
1Alloy Design and Thermomechanical Processing, Microstructure Physics and Alloy Design, Max-Planck-Institut für Eisenforschung GmbH, Max Planck Society, ou_1863383              
2High-Entropy Alloys, Microstructure Physics and Alloy Design, Max-Planck-Institut für Eisenforschung GmbH, Max Planck Society, ou_3010672              
3Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445634              
4Research Group Parasitology, Department Evolutionary Ecology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445643              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Parasitic nematodes (roundworms) and platyhelminths (flatworms) cause debilitating chronic infections of humans and animals, decimate crop production and are a major impediment to socioeconomic development. Here we report a broad comparative study of 81 genomes of parasitic and non-parasitic worms. We have identified gene family births and hundreds of expanded gene families at key nodes in the phylogeny that are relevant to parasitism. Examples include gene families that modulate host immune responses, enable parasite migration though host tissues or allow the parasite to feed. We reveal extensive lineage-specific differences in core metabolism and protein families historically targeted for drug development. From an in silico screen, we have identified and prioritized new potential drug targets and compounds for testing. This comparative genomics resource provides a much-needed boost for the research community to understand and combat parasitic worms.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2018-05-172018-09-242018-11-052018
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: DOI: 10.1038/s41588-018-0262-1
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature Genetics
  Andere : Nature Genet.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Nature America, Inc.
Seiten: - Band / Heft: 51 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 163 - 174 Identifikator: ISSN: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609