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  Multi-contrast submillimetric 3 Tesla hippocampal subfield segmentation protocol and dataset

Kulaga-Yoskovitz, J., Bernhardt, B. C., Hong, S.-J., Mansi, T., Liang, K. E., Van der Kouwe, A. J., Smallwood, J., Bernasconi, A., & Bernasconi, N. (2015). Multi-contrast submillimetric 3 Tesla hippocampal subfield segmentation protocol and dataset. Scientific Data, 2:. doi:10.1038/sdata.2015.59.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-E5E8-6 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0003-605A-C
資料種別: 学術論文

ファイル

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:
Kulaga-Yoskovitz_2015.pdf (出版社版), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-E5EA-4
ファイル名:
Kulaga-Yoskovitz_2015.pdf
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Kulaga-Yoskovitz, Jessie 1, 著者
Bernhardt, Boris C.1, 2, 著者           
Hong, Seok-Jun 1, 著者
Mansi, Tommaso 1, 著者
Liang, Kevin E. 1, 著者
Van der Kouwe, Andre J.W. 1, 著者
Smallwood, Jonathan1, 著者           
Bernasconi, Andrea 1, 著者
Bernasconi, Neda 1, 著者
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Department Social Neuroscience, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, ou_634552              

内容説明

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キーワード: Brain; Brain imaging; Magnetic resonance imaging; Neurology; Neuroscience
 要旨: The hippocampus is composed of distinct anatomical subregions that participate in multiple cognitive processes and are differentially affected in prevalent neurological and psychiatric conditions. Advances in high-field MRI allow for the non-invasive identification of hippocampal substructure. These approaches, however, demand time-consuming manual segmentation that relies heavily on anatomical expertise. Here, we share manual labels and associated high-resolution MRI data (MNI-HISUB25; submillimetric T1- and T2-weighted images, detailed sequence information, and stereotaxic probabilistic anatomical maps) based on 25 healthy subjects. Data were acquired on a widely available 3 Tesla MRI system using a 32 phased-array head coil. The protocol divided the hippocampal formation into three subregions: subicular complex, merged Cornu Ammonis 1, 2 and 3 (CA1-3) subfields, and CA4-dentate gyrus (CA4-DG). Segmentation was guided by consistent intensity and morphology characteristics of the densely myelinated molecular layer together with few geometry-based boundaries flexible to overall mesiotemporal anatomy, and achieved excellent intra-/inter-rater reliability (Dice index ≥90/87%). The dataset can inform neuroimaging assessments of the mesiotemporal lobe and help to develop segmentation algorithms relevant for basic and clinical neurosciences.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2015-08-102015-10-072015-11-10
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/sdata.2015.59
PMID: 26594378
PMC: PMC4640139
その他: eCollection 2015
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Scientific Data
  省略形 : Sci. Data
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London, United Kingdom : Nature Publishing Group
ページ: - 巻号: 2 通巻号: 150059 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2052-4463
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2052-4463