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  Perseus: A Bioinformatics Platform for Integrative Analysis of Proteomics Data in Cancer Research

Tyanova, S., & Cox, J. (2018). Perseus: A Bioinformatics Platform for Integrative Analysis of Proteomics Data in Cancer Research. In L. von Stechow (Ed.), Cancer Systems Biology (pp. 133-148). New York, NY: Humana Press. doi:10.1007/978-1-4939-7493-1_7.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-FDBB-F Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-FDBC-E
Genre: Buchkapitel

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Tyanova-Cox2018_Protocol_PerseusABioinformaticsPlatform.pdf (Verlagsversion), 778KB
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Datei-Permalink:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0002-FDBD-D
Name:
Tyanova-Cox2018_Protocol_PerseusABioinformaticsPlatform.pdf
Beschreibung:
-
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Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
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Copyright Datum:
-
Copyright Info:
© The Author(s) 2018
Lizenz:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Tyanova, Stefka1, Autor           
Cox, Jürgen1, Autor           
Affiliations:
1Cox, Jürgen / Computational Systems Biochemistry, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_2063284              

Inhalt

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Schlagwörter: Perseus; Software; Omics data analysis; Translational bioinformatics Cancer proteomics
 Zusammenfassung: Mass spectrometry-based proteomics is a continuously growing field marked by technological and methodological improvements. Cancer proteomics is aimed at pursuing goals such as accurate diagnosis, patient stratification, and biomarker discovery, relying on the richness of information of quantitative proteome profiles. Translating these high-dimensional data into biological findings of clinical importance necessitates the use of robust and powerful computational tools and methods. In this chapter, we provide a detailed description of standard analysis steps for a clinical proteomics dataset performed in Perseus, a software for functional analysis of large-scale quantitative omics data.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2018-012018
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: 000431344900008
DOI: 10.1007/978-1-4939-7493-1_7
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Cancer Systems Biology
  Untertitel : Methods and Protocols
Genre der Quelle: Buch
 Urheber:
von Stechow, Louise, Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Humana Press
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 133 - 148 Identifikator: ISSN: 1064-3745
ISBN: 978-1-4939-7493-1; 978-1-4939-7492-4

Quelle 2

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Titel: Methods in Molecular Biology
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Humana Press
Seiten: - Band / Heft: 1711 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1064-3745