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  Phylogenomics insights into order and families of Lysobacterales

Kumar, S., Bansal, K., Patil, P. P., & Patil, P. B. (2019). Phylogenomics insights into order and families of Lysobacterales. Access Microbiology, 1(2). doi:10.1099/acmi.0.000015.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

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shh2213.pdf (Verlagsversion), 4MB
Name:
shh2213.pdf
Beschreibung:
OA
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Kumar, Sanjeet1, Autor           
Bansal, Kanika, Autor
Patil, Prashant P., Autor
Patil, Prabhu B., Autor
Affiliations:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Order Lysobacterales (earlier known Xanthomonadales ) is a taxonomically complex group of a large number of gamma-proteobacteria classified in two different families, namely Lysobacteraceae and Rhodanobacteraceae . Current taxonomy is largely based on classical approaches and is devoid of whole-genome information-based analysis. In the present study, we have taken all classified and poorly described species belonging to the order Lysobacterales to perform a phylogenetic analysis based on the 16 S rRNA sequence. Moreover, to obtain robust phylogeny, we have generated whole-genome sequencing data of six type species namely Metallibacterium scheffleri , Panacagrimonas perspica , Thermomonas haemolytica , Fulvimonas soli , Pseudofulvimonas gallinarii and Rhodanobacter lindaniclasticus of the families Lysobacteraceae and Rhodanobacteraceae . Interestingly, whole-genome-based phylogenetic analysis revealed unusual positioning of the type species Pseudofulvimonas , Panacagrimonas , Metallibacterium and Aquimonas at family level. Whole-genome-based phylogeny involving 92 type strains resolved the taxonomic positioning by reshuffling the genus across families Lysobacteraceae and Rhodanobacteraceae . The present study reveals the need and scope for genome-based phylogenetic and comparative studies in order to address relationships of genera and species of order Lysobacterales.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2019-04-17
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 9
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1099/acmi.0.000015
Anderer: shh2213
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Access Microbiology
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London : Microbiology Society
Seiten: - Band / Heft: 1 (2) Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 2516-8290