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  Flat-top TIRF illumination boosts DNA-PAINT imaging and quantification

Stehr, F., Stein, J., Schueder, F., Schwille, P., & Jungmann, R. (2019). Flat-top TIRF illumination boosts DNA-PAINT imaging and quantification. Nature Communications, 10: 1268. doi:10.1038/s41467-019-09064-6.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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s41467-019-09064-6.pdf (Verlagsversion), 4MB
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-
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Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
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-
Copyright Info:
Open Access
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41467_2019_9064_MOESM1_ESM.pdf (Ergänzendes Material), 4MB
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41467_2019_9064_MOESM1_ESM.pdf
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Öffentlich
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Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Stehr, Florian1, Autor           
Stein, Johannes1, Autor           
Schueder, Florian2, Autor           
Schwille, Petra1, Autor           
Jungmann, Ralf2, Autor           
Affiliations:
1Schwille, Petra / Cellular and Molecular Biophysics, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565169              
2Jungmann, Ralf / Molecular Imaging and Bionanotechnology, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_2149679              

Inhalt

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Schlagwörter: SUPERRESOLUTION MICROSCOPY; LOCALIZATION MICROSCOPY; PERFORMANCE; BINDINGScience & Technology - Other Topics;
 Zusammenfassung: Super-resolution (SR) techniques have extended the optical resolution down to a few nanometers. However, quantitative treatment of SR data remains challenging due to its complex dependence on a manifold of experimental parameters. Among the different SR variants, DNA-PAINT is relatively straightforward to implement, since it achieves the necessary 'blinking' without the use of rather complex optical or chemical activation schemes. However, it still suffers from image and quantification artifacts caused by inhomogeneous optical excitation. Here we demonstrate that several experimental challenges can be alleviated by introducing a segment-wise analysis approach and ultimately overcome by implementing a flat-top illumination profile for TIRF microscopy using a commercially-available beam-shaping device. The improvements with regards to homogeneous spatial resolution and precise kinetic information over the whole field-of-view were quantitatively assayed using DNA origami and cell samples. Our findings open the door to high-throughput DNA-PAINT studies with thus far unprecedented accuracy for quantitative data interpretation.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2019
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 8
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: 000461757400006
DOI: 10.1038/s41467-019-09064-6
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Projektname : (DFG JU 2957/1-1 to R.J.)
Grant ID : -
Förderprogramm : Emmy Noether Program
Förderorganisation : German Research Foundation
Projektname : ERC Starting Grant (MolMap)
Grant ID : 680241
Förderprogramm : -
Förderorganisation : European Research Council

Quelle 1

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Titel: Nature Communications
  Kurztitel : Nat. Commun.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London : Nature Publishing Group
Seiten: - Band / Heft: 10 Artikelnummer: 1268 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 2041-1723
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2041-1723