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  Molecule counts in complex oligomers with single-molecule localization microscopy

Baldering, T. N., Bullerjahn, J. T., Hummer, G., Heilemann, M., & Malkusch, S. (2019). Molecule counts in complex oligomers with single-molecule localization microscopy. Journal of Physics D: Applied Physics, 52(47):. doi:10.1088/1361-6463/ab3b65.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0004-C094-B 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-2AA9-7
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Baldering, Tim N.1, 著者
Bullerjahn, Jakob T.2, 著者                 
Hummer, Gerhard2, 著者                 
Heilemann, Mike1, 著者
Malkusch, Sebastian1, 著者
所属:
1Institute of Physical and Theoretical Chemistry, Goethe-University Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany, ou_persistent22              
2Department of Theoretical Biophysics, Max Planck Institute of Biophysics, Max Planck Society, ou_2068292              

内容説明

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キーワード: fluorescent proteins, molecular counting, photoactivated-localization microscopy, single-molecule localization microscopy
 要旨: Single-molecule localization microscopy resolves nano-scale protein clusters in cells, and in addition can extract protein copy numbers from within these clusters. A powerful approach for such molecular counting is the analysis of fluorophore blinking using stochastic model functions. Here, we develop a theoretical model for quantitative analysis of PALM data that accounts for the detection efficiency. By this, we are able to extract populations of different oligomers reliably and in complex mixtures. We demonstrate this approach analyzing simulated PALM data of a photoactivatable fluorescent protein. We generate simulations of blinking data of oligomers and of mixtures of oligomers, and show robust oligomer identification. In addition, we demonstrate this approach for experimental PALM data.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2019-06-082019-08-152019-09-062019-11-20
 出版の状態: 出版
 ページ: 14
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1088/1361-6463/ab3b65
BibTex参照ID: baldering_molecule_2019
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Journal of Physics D: Applied Physics
  省略形 : J. Phys. D: Appl. Phys.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Bristol : IOP Publishing
ページ: - 巻号: 52 (47) 通巻号: 474002 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0022-3727
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/0022-3727