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  Validation of noise models for single-cell transcriptomics enables genome-wiede quentification of stochastic gene expression

Grün, D., Kester, L., & van Oudenaarden, &. A. (2014). Validation of noise models for single-cell transcriptomics enables genome-wiede quentification of stochastic gene expression. Nature methods, 11, 637-640. doi:10.1038/nmeth.2930.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Grün, Dominic1, Autor           
Kester, Lennart2, Autor
van Oudenaarden, & Alexander2, Autor
Affiliations:
1Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Max Planck Society, ou_2243642              
2External Organizations, ou_persistent22              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Single-cell transcriptomics has recently emerged as a powerful technology to explore gene expression heterogeneity among single cells. Here we identify two major sources of technical variability: sampling noise and global cell-to-cell variation in sequencing efficiency. We propose noise models to correct for this, which we validate using single-molecule FISH. We demonstrate that gene expression variability in mouse embryonic stem cells depends on the culture condition.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2014
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1038/nmeth.2930
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature methods
  Andere : Nature methods
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Nature Pub. Group
Seiten: - Band / Heft: 11 Artikelnummer: - Start- / Endseite: 637 - 640 Identifikator: ISSN: 1548-7091
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111088195279556