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  Pancreatic ductal adenocarcinomas from Mexican patients present a distinct genomic mutational pattern

Sanchez, P., Espinosa, M., Maldonado, V., Barquera, R., Belem-Gabiño, N., Torres, J., Cravioto, A., & Melendez-Zajgla, J. (2020). Pancreatic ductal adenocarcinomas from Mexican patients present a distinct genomic mutational pattern. Molecular Biology Reports,. doi:10.1007/s11033-020-05592-3.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0006-9DF5-5 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0006-9E7F-B
資料種別: 学術論文

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shh2644.pdf (出版社版), 3MB
 
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shh2644.pdf
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非公開
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application/pdf
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作成者

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 作成者:
Sanchez, Paulina, 著者
Espinosa, Magali, 著者
Maldonado, Vilma, 著者
Barquera, Rodrigo1, 著者           
Belem-Gabiño, Nayeli, 著者
Torres, Javier, 著者
Cravioto, Adrian, 著者
Melendez-Zajgla, Jorge, 著者
所属:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              

内容説明

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キーワード: PDAC, Exome sequencing
 要旨: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the deadliest cancers in humans, with less than 5% 5-year survival rate. PDAC is characterized by a small number of recurrent mutations, including KRAS, CDKN2A, TP53, and SMAD4 and a long “tail” of infrequent mutated genes. Most of the studies have been performed in US and European populations, so new studies are needed to describe the mutational landscape of these tumors in other cohorts. The present study analyzed the exome and transcriptome of four PDAC tumors from Mexican patients. We found a paucity of the previously described recurrent mutations, with mutations in only three genes (HERC2, CNTNAP2 and HMCN1) previously reported in PDAC with a frequency > 1%. In addition, we discovered several recurrent putative copy number aberrations in SKP2, BRAF, CSSF1R, FOXE1, JAK2 and MET genes and in genes previously reported as putative drivers in PDAC, including KRAS, SF3B1, BRAF, MYC and MET. Although a larger cohort is needed to validate these findings, our results could be pointing toward potential differences in contributing factors for PDAC in Latin-American populations.

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言語: eng - English
 日付: 2020-06-24
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: 10
 出版情報: -
 目次: Introduction. - Materials and methods (sample collection, sample processing, nuclelc acid extraction, exome sequencing, validation, interaction networks, ancestry analysis, data availlability). - Results. - Discussions
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1007/s11033-020-05592-3
その他: shh2644
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Molecular Biology Reports
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: The Hague [etc.] : W. Junk [etc.]
ページ: - 巻号: - 通巻号: s11033-020-05592-3 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0301-4851
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925510393