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  Neolithic and medieval virus genomes reveal complex evolution of Hepatitis B

Krause-Kyora, B., Susat, J., Key, F. M., Kühnert, D., Bosse, E., Immel, A., Rinne, C., Kornell, S.-C., Yepes, D., Franzenburg, S., Heyne, H. O., Meier, T., Lösch, S., Meller, H., Friederich, S., Nicklisch, N., Alt, K. W., Schreiber, S., Tholey, A., Herbig, A., Nebel, A., & Krause, J. (2018). Neolithic and medieval virus genomes reveal complex evolution of Hepatitis B. eLife, 7:. doi:10.7554/eLife.36666.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-2E4B-3 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-B458-7
資料種別: 学術論文

ファイル

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:
Krause-Kyora_Neolithic_eLife_2018.pdf (出版社版), 1014KB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-2E4D-1
ファイル名:
Krause-Kyora_Neolithic_eLife_2018.pdf
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
2018
著作権情報:
-

関連URL

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作成者

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 作成者:
Krause-Kyora, Ben1, 著者           
Susat, Julian, 著者
Key, Felix M.1, 著者                 
Kühnert, Denise2, 著者                 
Bosse, Esther, 著者
Immel, Alexander1, 著者           
Rinne, Christoph, 著者
Kornell, Sabin-Christin, 著者
Yepes, Diego, 著者
Franzenburg, Sören, 著者
Heyne, Henrike O, 著者
Meier, Thomas, 著者
Lösch, Sandra, 著者
Meller, Harald, 著者
Friederich, Susanne, 著者
Nicklisch, Nicole, 著者
Alt, Kurt W, 著者
Schreiber, Stefan, 著者
Tholey, Andreas, 著者
Herbig, Alexander1, 著者                 
Nebel, Almut, 著者Krause, Johannes1, 著者                  全て表示
所属:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              
2tide, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2591691              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The hepatitis B virus (HBV) is one of the most widespread human pathogens known today, yet its origin and evolutionary history are still unclear and controversial. Here, we report the analysis of three ancient HBV genomes recovered from human skeletons found at three different archaeological sites in Germany. We reconstructed two Neolithic and one medieval HBV genomes by ̑extitde novo assembly from shotgun DNA sequencing data. Additionally, we observed HBV-specific peptides using paleo-proteomics. Our results show that HBV circulates in the European population for at least 7000 years. The Neolithic HBV genomes show a high genomic similarity to each other. In a phylogenetic network, they do not group with any human-associated HBV genome and are most closely related to those infecting African non-human primates. These ancient virus forms appear to represent distinct lineages that have no close relatives today and possibly went extinct. Our results reveal the great potential of ancient DNA from human skeletons in order to study the long-time evolution of blood borne viruses.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2018-05-10
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: 20
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.7554/eLife.36666
その他: shh996
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: eLife
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
Locarnini, Stephen, 編集者
所属:
-
出版社, 出版地: Cambridge : eLife Sciences Publications
ページ: - 巻号: 7 通巻号: e36666 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2050-084X
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2050-084X