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  Phylogeography of the second plague pandemic revealed through analysis of historical Yersinia pestis genomes

Spyrou, M. A., Keller, M., Tukhbatova, R. I., Scheib, C. L., Nelson, E. A., Andrades Valtueña, A., Neumann, G., Walker, D., Alterauge, A., Carty, N., Cessford, C., Fetz, H., Gourvennec, M., Hartle, R., Henderson, M., von Heyking, K., Inskip, S. A., Kacki, S., Key, F. M., Knox, E. L., Later, C., Maheshwari-Aplin, P., Peters, J., Robb, J. E., Schreiber, J., Kivisild, T., Castex, D., Lösch, S., Harbeck, M., Herbig, A., Bos, K. I., & Krause, J. (2019). Phylogeography of the second plague pandemic revealed through analysis of historical Yersinia pestis genomes. Nature Communications, 10(1):. doi:10.1038/s41467-019-12154-0.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-3031-B 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-FE3A-7
資料種別: 学術論文

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:
Spyrou_Phylogeography_NatComm_2019.pdf (出版社版), 9MB
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ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-3033-9
ファイル名:
Spyrou_Phylogeography_NatComm_2019.pdf
説明:
-
OA-Status:
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
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著作権日付:
2019
著作権情報:
-
CCライセンス:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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作成者

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 作成者:
Spyrou, Maria A.1, 著者                 
Keller, Marcel1, 著者           
Tukhbatova, Rezeda I.1, 著者           
Scheib, Christiana L., 著者
Nelson, Elizabeth A.1, 著者           
Andrades Valtueña, Aida1, 著者                 
Neumann, Gunnar1, 著者                 
Walker, Don, 著者
Alterauge, Amelie, 著者
Carty, Niamh, 著者
Cessford, Craig, 著者
Fetz, Hermann, 著者
Gourvennec, Michaël, 著者
Hartle, Robert, 著者
Henderson, Michael, 著者
von Heyking, Kristin, 著者
Inskip, Sarah A., 著者
Kacki, Sacha, 著者
Key, Felix M., 著者
Knox, Elizabeth L., 著者
Later, Christian, 著者Maheshwari-Aplin, Prishita, 著者Peters, Joris, 著者Robb, John E., 著者Schreiber, Jürgen, 著者Kivisild, Toomas, 著者Castex, Dominique, 著者Lösch, Sandra, 著者Harbeck, Michaela, 著者Herbig, Alexander1, 著者                 Bos, Kirsten I.1, 著者                 Krause, Johannes1, 著者                  全て表示
所属:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The second plague pandemic, caused by Yersinia pestis, devastated Europe and the nearby regions between the 14th and 18th centuries AD. Here we analyse human remains from ten European archaeological sites spanning this period and reconstruct 34 ancient Y. pestis genomes. Our data support an initial entry of the bacterium through eastern Europe, the absence of genetic diversity during the Black Death, and low within-outbreak diversity thereafter. Analysis of post-Black Death genomes shows the diversification of a Y. pestis lineage into multiple genetically distinct clades that may have given rise to more than one disease reservoir in, or close to, Europe. In addition, we show the loss of a genomic region that includes virulence-related genes in strains associated with late stages of the pandemic. The deletion was also identified in genomes connected with the first plague pandemic (541-750 AD), suggesting a comparable evolutionary trajectory of Y. pestis during both events.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2019-10-02
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: 13
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/s41467-019-12154-0
その他: shh2435
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Communications
  省略形 : Nat. Commun.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London : Nature Publishing Group
ページ: - 巻号: 10 (1) 通巻号: 4470 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 2041-1723
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2041-1723