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  A systematic investigation of human DNA preservation in medieval skeletons

Parker, E. C., Rohrlach, A. B., Friederich, S., Nagel, S., Meyer, M., Krause, J., et al. (2020). A systematic investigation of human DNA preservation in medieval skeletons. Scientific Reports, 10(1): 18225. doi:10.1038/s41598-020-75163-w.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

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shh2761.pdf (Verlagsversion), 3MB
Name:
shh2761.pdf
Beschreibung:
OA
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-

Externe Referenzen

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Supplementary Information 1. (Ergänzendes Material)
Beschreibung:
(last seen Nov. 2020)
OA-Status:
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Beschreibung:
(last seen Nov. 2020)
OA-Status:

Urheber

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 Urheber:
Parker, Edward Cody1, Autor           
Rohrlach, Adam Ben1, Autor           
Friederich, Susanne, Autor
Nagel, Sarah, Autor           
Meyer, Matthias, Autor           
Krause, Johannes1, 2, Autor           
Bos, Kirsten I.1, Autor           
Haak, Wolfgang1, Autor           
Affiliations:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              
2MHAAM, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2541699              

Inhalt

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Schlagwörter: Biological anthropology, High-throughput screening, Population genetics
 Zusammenfassung: Ancient DNA (aDNA) analyses necessitate the destructive sampling of archaeological material. Currently, the cochlea, part of the osseous inner ear located inside the petrous pyramid, is the most sought after skeletal element for molecular analyses of ancient humans as it has been shown to yield high amounts of endogenous DNA. However, destructive sampling of the petrous pyramid may not always be possible, particularly in cases where preservation of skeletal morphology is of top priority. To investigate alternatives, we present a survey of human aDNA preservation for each of ten skeletal elements in a skeletal collection from Medieval Germany. Through comparison of human DNA content and quality we confirm best performance of the petrous pyramid and identify seven additional sampling locations across four skeletal elements that yield adequate aDNA for most applications in human palaeogenetics. Our study provides a better perspective on DNA preservation across the human skeleton and takes a further step toward the more responsible use of ancient materials in human aDNA studies.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2020-10-26
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 16
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: Introduction
Results
Discussion
Conclusions
Methods
- Sample selection, pre‑treatment, and bone powder generation
- DNA extraction, library preparation, and sequencing
- Evaluation criteria
- Contamination estimates
- Mapping
- Calculations
- Mixed effects modelling
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1038/s41598-020-75163-w
Anderer: shh2761
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Projektname : PALEoRIDER
Grant ID : 771234
Förderprogramm : Horizon 2020 (H2020)
Förderorganisation : European Commission (EC)
Projektname : CoDisEASe
Grant ID : 805268
Förderprogramm : Horizon 2020 (H2020)
Förderorganisation : European Commission (EC)

Quelle 1

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Titel: Scientific Reports
  Kurztitel : Sci. Rep.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London, UK : Nature Publishing Group
Seiten: - Band / Heft: 10 (1) Artikelnummer: 18225 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 2045-2322
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2045-2322