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  Do I have something in my teeth? The trouble with genetic analyses of diet from archaeological dental calculus

Mann, A. E., Fellows Yates, J. A., Fagernäs, Z., Austin, R. M., Nelson, E. A., & Hofman, C. A. (2023). Do I have something in my teeth? The trouble with genetic analyses of diet from archaeological dental calculus. Quaternary International, 653–654:, pp. 33-46. doi:10.1016/j.quaint.2020.11.019.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-73CB-3 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-9D4D-C
資料種別: 学術論文

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:
shh2769.pdf (出版社版), 5MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-9D4B-E
ファイル名:
shh2769.pdf
説明:
-
OA-Status:
Hybrid
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公開
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application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
:
shh2769pre.pdf (プレプリント), 5MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-9D4C-D
ファイル名:
shh2769pre.pdf
説明:
OA. - In Press, Corrected Proof
OA-Status:
Green
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-

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Multimedia component 1. (付録資料)
説明:
(last checked: Nov. 2020)
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説明:
(last checked: Nov. 2020)
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作成者

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 作成者:
Mann, Allison E., 著者
Fellows Yates, James A.1, 著者           
Fagernäs, Zandra1, 著者           
Austin, Rita M., 著者
Nelson, Elizabeth A.1, 著者           
Hofman, Courtney A., 著者
所属:
1Archaeogenetics, Max Planck Institute for the Science of Human History, Max Planck Society, ou_2074310              

内容説明

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キーワード: Diet, Dental calculus, Metagenomics, Ancient DNA
 要旨: Dental calculus and other preserved microbiome substrates are an attractive target for dietary reconstruction in past populations through a variety of physical, chemical, and molecular means. Recently, studies have attempted to reconstruct diet from archaeological dental calculus using archaeogenetic techniques. While dental calculus may provide a relatively stable environment for DNA preservation, the detection of plants and animals possibly consumed by an individual through DNA analysis is primarily hindered by microbial richness and incomplete reference databases. Moreover, high genomic similarity within eukaryotic groups

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2020-08-032020-11-122020-11-192023-04-20
 出版の状態: 出版
 ページ: 14
 出版情報: -
 目次: 1. Introduction
2. Materials and methods
3. Results
3.1. Effects of low read counts on damage patterns
3.2. Identification of dietary reads from synthetic datasets
3.3. Identification of dietary reads from real datasets
4. Discussion and conclusions
4.1. Checklist for authors and reviewers
4.1.1. Field/storage contamination
4.1.2. Is the laboratory methodology suitable for aDNA authentication?
4.1.3. Is the database and pipeline suitable?
4.1.4. Is the taxonomic resolution analyzed sufficient for reliable interpretation?
4.1.5. Have unexpected taxa been reported and evaluated?
4.1.6. Have laboratory controls been evaluated alongside samples?
4.1.7. Has evidence of aDNA authenticity been provided?
4.1.8. Is there other evidence supporting that dietary organisms were
consumed?
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1016/j.quaint.2020.11.019
その他: shh2769
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Quaternary International
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Pergamon
ページ: - 巻号: 653–654 通巻号: 2020.11.019 開始・終了ページ: 33 - 46 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1040-6182
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925588348