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  How to predict relapse in leukaemia using time series data: A comparative in silico study

Hoffmann, H., Baldow, C., Zerjatke, T., Gottschalk, A., Wagner, S., Karg, E., Niehaus, S., Roeder, I., Glauche, I., & Scherf, N. (2020). How to predict relapse in leukaemia using time series data: A comparative in silico study. medRxiv. doi:10.1101/2020.12.04.20243907.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0007-D26B-4 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-0FA8-6
資料種別: Preprint

ファイル

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:
Hoffmann_pre.pdf (プレプリント), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-3F84-9
ファイル名:
Hoffmann_pre.pdf
説明:
-
OA-Status:
Green
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-

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作成者

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 作成者:
Hoffmann, Helene, 著者
Baldow, Christoph, 著者
Zerjatke, Thomas, 著者
Gottschalk, Andrea, 著者
Wagner, Sebastian, 著者
Karg, Elena, 著者
Niehaus, Sebastian, 著者
Roeder, Ingo, 著者
Glauche, Ingmar, 著者
Scherf, Nico1, 著者                 
所属:
1Method and Development Group Neural Data Science and Statistical Computing, MPI for Human Cognitive and Brain Sciences, Max Planck Society, ou_3282987              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Risk stratification and treatment decisions for leukaemia patients are regularly based on clinical markers determined at diagnosis, while measurements on system dynamics are often neglected. However, there is increasing evidence that linking quantitative time-course information to disease outcomes can improving the predictions for patient-specific treatment response.

We analyzed the potential of different computational methods to accurately predict relapse for chronic and acute myeloid leukaemia, particularly focusing on the influence of data quality and quantity. Technically, we used clinical reference data to generate in-silico patients with varying levels of data quality. Based hereon, we compared the performance of mechanistic models, generalized linear models, and neural networks with respect to their accuracy for relapse prediction. We found that data quality has a higher impact on prediction accuracy than the specific choice of the method. We further show that adapted treatment and measurement schemes can considerably improve prediction accuracy. Our proof-of-principle study highlights how computational methods and optimized data acquisition strategies can improve risk assessment and treatment of leukaemia patients.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2020-12-07
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1101/2020.12.04.20243907
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: medRxiv
種別: Web Page
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -