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  Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices

Alseekh, S., Aharoni, A., Brotman, Y., Contrepois, K., D’Auria, J., Ewald, J., C. Ewald, J., Fraser, P. D., Giavalisco, P., Hall, R. D., Heinemann, M., Link, H., Luo, J., Neumann, S., Nielsen, J., de Souza, L. P., Saito, K., Sauer, U., Schroeder, F. C., Schuster, S., Siuzdak, G., Skirycz, A., Sumner, L. W., Snyder, M. P., Tang, H., Tohge, T., Wang, Y., Wen, W., Wu, S., Xu, G., Zamboni, N., & Fernie, A. R. (2021). Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nature Methods, 18(7), 747-756. doi:10.1038/s41592-021-01197-1.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0008-D920-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-6EC6-A
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Alseekh, S.1, 著者           
Aharoni, Asaph2, 著者
Brotman, Yariv2, 著者
Contrepois, Kévin2, 著者
D’Auria, John2, 著者
Ewald, Jan2, 著者
C. Ewald, Jennifer2, 著者
Fraser, Paul D.2, 著者
Giavalisco, Patrick2, 著者
Hall, Robert D.2, 著者
Heinemann, Matthias2, 著者
Link, Hannes2, 著者
Luo, Jie2, 著者
Neumann, Steffen2, 著者
Nielsen, Jens2, 著者
de Souza, L. P.3, 著者           
Saito, Kazuki2, 著者
Sauer, Uwe2, 著者
Schroeder, Frank C.2, 著者
Schuster, Stefan2, 著者
Siuzdak, Gary2, 著者Skirycz, A.4, 著者           Sumner, Lloyd W.2, 著者Snyder, Michael P.2, 著者Tang, Huiru2, 著者Tohge, Takayuki2, 著者Wang, Yulan2, 著者Wen, Weiwei2, 著者Wu, Si2, 著者Xu, Guowang2, 著者Zamboni, Nicola2, 著者Fernie, A. R.3, 著者            全て表示
所属:
1The Genetics of Crop Metabolism, Department Willmitzer, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_3244836              
2external, ou_persistent22              
3Central Metabolism, Department Willmitzer, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753339              
4Small-Molecule Signalling, Department Willmitzer, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_2586692              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Mass spectrometry-based metabolomics approaches can enable detection and quantification of many thousands of metabolite features simultaneously. However, compound identification and reliable quantification are greatly complicated owing to the chemical complexity and dynamic range of the metabolome. Simultaneous quantification of many metabolites within complex mixtures can additionally be complicated by ion suppression, fragmentation and the presence of isomers. Here we present guidelines covering sample preparation, replication and randomization, quantification, recovery and recombination, ion suppression and peak misidentification, as a means to enable high-quality reporting of liquid chromatography– and gas chromatography–mass spectrometry-based metabolomics-derived data.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2021-07-12
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/s41592-021-01197-1
その他: Alseekh2021
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Nature Methods
  その他 : Nature Methods
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature Pub. Group
ページ: - 巻号: 18 (7) 通巻号: - 開始・終了ページ: 747 - 756 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1548-7091
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111088195279556