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  Detecting structural heterogeneity in single-molecule localization microscopy data

Huijben, T. A. P. M., Heydarian, H., Auer, A., Schueder, F., Jungmann, R., Stallinga, S., et al. (2021). Detecting structural heterogeneity in single-molecule localization microscopy data. Nature Communications, 12(1): 3791. doi:10.1038/s41467-021-24106-8.

Item is

Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Huijben, Teun A. P. M.1, Autor
Heydarian, Hamidreza1, Autor
Auer, Alexander2, Autor           
Schueder, Florian2, Autor           
Jungmann, Ralf2, Autor           
Stallinga, Sjoerd1, Autor
Rieger, Bernd1, Autor
Affiliations:
1external, ou_persistent22              
2Jungmann, Ralf / Molecular Imaging and Bionanotechnology, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_2149679              

Inhalt

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Schlagwörter: NUCLEAR-PORE COMPLEX; SUPERRESOLUTION MICROSCOPY; PARTICLE RECONSTRUCTIONScience & Technology - Other Topics;
 Zusammenfassung: Particle fusion for single molecule localization microscopy improves signal-to-noise ratio and overcomes underlabeling, but ignores structural heterogeneity or conformational variability. We present a-priori knowledge-free unsupervised classification of structurally different particles employing the Bhattacharya cost function as dissimilarity metric. We achieve 96% classification accuracy on mixtures of up to four different DNA-origami structures, detect rare classes of origami occuring at 2% rate, and capture variation in ellipticity of nuclear pore complexes.
Particle fusion can improve signal-to-noise ratio in single molecule localization microscopy, but is limited by structural heterogeneity. Here, the authors demonstrate an unsupervised classification method that differentiates structurally different DNA origami structures without prior knowledge.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2021
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 8
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: ISI: 000665040300020
DOI: 10.1038/s41467-021-24106-8
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature Communications
  Kurztitel : Nat. Commun.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: London : Nature Publishing Group
Seiten: - Band / Heft: 12 (1) Artikelnummer: 3791 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 2041-1723
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2041-1723