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  Phosphoproteome and Proteome Sample Preparation from Mouse Tissues for Circadian Analysis

Brüning, F., Humphrey, S. J., & Robles, M. S. (2021). Phosphoproteome and Proteome Sample Preparation from Mouse Tissues for Circadian Analysis. In S. A. Brown (Ed.), Circadian Clocks. Methods in Molecular Biology, vol 2130. (pp. 185-193). New York, NY: Humana.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0009-7B7E-1 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0009-7B7F-0
Genre: Buchkapitel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Brüning, Franziska1, Autor           
Humphrey, Sean J.2, Autor
Robles, Maria S.2, Autor
Affiliations:
1Mann, Matthias / Proteomics and Signal Transduction, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565159              
2external, ou_persistent22              

Inhalt

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Schlagwörter: GENE-EXPRESSION; REVEALS; BIOLOGYBiochemistry & Molecular Biology; Phosphoproteomics; Proteomics; Circadian; Mass spectrometry;
 Zusammenfassung: Recent advances in mass spectrometry (MS)-based quantitative proteomics now allow the identification and quantification of deep proteomes and post-translational modifications (PTMs) in relatively short times. Therefore, in the last few years, this technology has proven successful in the circadian field to characterize temporal oscillations of the proteome and more recently PTMs in cellular systems and in tissues. In this chapter, we describe a robust and simple protocol, based on the EasyPhos workflow, to enable preparation of large number of proteomes and phosphoproteomes from mouse tissues for MS-based quantitative analysis. We additionally discuss computational methods to analyze proteome and phosphoproteome time series to determine circadian oscillations.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2021
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: 9
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: 000707157300015
DOI: 10.1007/978-1-0716-0381-9_14
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Circadian Clocks. Methods in Molecular Biology, vol 2130.
  Andere : Circadian Clocks: Methods and Protocols
Genre der Quelle: Buch
 Urheber:
Brown, Steven A., Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Humana
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 185 - 193 Identifikator: ISSN: 1064-3745
ISBN: 978-1-0716-0381-9; 978-1-0716-0380-2

Quelle 2

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Titel: Methods in Molecular Biology
  Alternativer Titel : METHODS MOL BIOL
  Alternativer Titel : Methods Mol. Biol.
Genre der Quelle: Reihe
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Humana
Seiten: - Band / Heft: 2130 Artikelnummer: - Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1064-3745