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  Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria

Murray, A. E., Freudenstein, J., Gribaldo, S., Hatzenpichler, R., Hugenholtz, P., Kaempfer, P., Konstantinidis, K. T., Lane, C. E., Papke, R. T., Parks, D. H., Rossello-Mora, R., Stott, M. B., Sutcliffe, I. C., Thrash, J. C., Venter, S. N., Whitman, W. B., Acinas, S. G., Amann I, R., Anantharaman, K., Armengaud, J., Baker, B. J., Barco, R. A., Bode, H. B., Boyd, E. S., Brady, C. L., Carini, P., Chain, P. S. G., Colman, D. R., DeAngelis, K. M., de los Rios, M. A., Estrada-de los Santos, P., Dunlap, C. A., Eisen, J. A., Emerson, D., Ettema, T. J. G., Eveillard, D., Girguis, P. R., Hentschel, U., Hollibaugh, J. T., Hug, L. A., Inskeep, W. P., Ivanova, E. P., Klenk, H.-P., Li, W.-J., Lloyd, K. G., Lffler, F. E., Makhalanyane, T. P., Moser, D. P., Nunoura, T., Palmer, M., Parro, V., Pedros-Alio, C., Probst, A. J., Smits, T. H. M., Steen, A. D., Steenkamp, E. T., Spang, A., Stewart, F. J., Tiedje, J. M., Vandamme, P., Wagner, M., Wang, F.-P., Hedlund, B. P., & Reysenbach, A.-L. (2020). Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria. NATURE MICROBIOLOGY, 5(8), 987-994. doi:10.1038/s41564-020-0733-x.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-0512-C 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-0513-B
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Murray, Alison E.1, 著者
Freudenstein, John1, 著者
Gribaldo, Simonetta1, 著者
Hatzenpichler, Roland1, 著者
Hugenholtz, Philip1, 著者
Kaempfer, Peter1, 著者
Konstantinidis, Konstantinos T.1, 著者
Lane, Christopher E.1, 著者
Papke, R. Thane1, 著者
Parks, Donovan H.1, 著者
Rossello-Mora, Ramon, 著者           
Stott, Matthew B.1, 著者
Sutcliffe, Iain C.1, 著者
Thrash, J. Cameron1, 著者
Venter, Stephanus N.1, 著者
Whitman, William B.1, 著者
Acinas, Silvia G.1, 著者
Amann I, Rudolf1, 著者
Anantharaman, Karthik1, 著者
Armengaud, Jean1, 著者
Baker, Brett J.1, 著者Barco, Roman A.1, 著者Bode, Helge B.2, 3, 著者           Boyd, Eric S.1, 著者Brady, Carrie L.1, 著者Carini, Paul1, 著者Chain, Patrick S. G.1, 著者Colman, Daniel R.1, 著者DeAngelis, Kristen M.1, 著者de los Rios, Maria Asuncion1, 著者Estrada-de los Santos, Paulina1, 著者Dunlap, Christopher A.1, 著者Eisen, Jonathan A.1, 著者Emerson, David1, 著者Ettema, Thijs J. G.1, 著者Eveillard, Damien1, 著者Girguis, Peter R.1, 著者Hentschel, Ute1, 著者Hollibaugh, James T.1, 著者Hug, Laura A.1, 著者Inskeep, William P.1, 著者Ivanova, Elena P.1, 著者Klenk, Hans-Peter1, 著者Li, Wen-Jun1, 著者Lloyd, Karen G.1, 著者Lffler, Frank E.1, 著者Makhalanyane, Thulani P.1, 著者Moser, Duane P.1, 著者Nunoura, Takuro1, 著者Palmer, Marike1, 著者Parro, Victor1, 著者Pedros-Alio, Carlos1, 著者Probst, Alexander J.1, 著者Smits, Theo H. M.1, 著者Steen, Andrew D.1, 著者Steenkamp, Emma T.1, 著者Spang, Anja1, 著者Stewart, Frank J.1, 著者Tiedje, James M.1, 著者Vandamme, Peter1, 著者Wagner, Michael, 著者           Wang, Feng-Ping1, 著者Hedlund, Brian P.1, 著者Reysenbach, Anna-Louise1, 著者 全て表示
所属:
1external, ou_persistent22              
2Natural Product Function and Engineering, Department of Natural Products in Organismic Interactions, Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Max Planck Society, ou_3266308              
3Goethe-Universität Frankfurt am Main, External Organizations, ou_421891              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The assembly of single-amplified genomes (SAGs) and metagenome-assembled genomes (MAGs) has led to a surge in genome-based discoveries of members affiliated with Archaea and Bacteria, bringing with it a need to develop guidelines for nomenclature of uncultivated microorganisms. The International Code of Nomenclature of Prokaryotes (ICNP) only recognizes cultures as 'type material', thereby preventing the naming of uncultivated organisms. In this Consensus Statement, we propose two potential paths to solve this nomenclatural conundrum. One option is the adoption of previously proposed modifications to the ICNP to recognize DNA sequences as acceptable type material; the other option creates a nomenclatural code for uncultivated Archaea and Bacteria that could eventually be merged with the ICNP in the future. Regardless of the path taken, we believe that action is needed now within the scientific community to develop consistent rules for nomenclature of uncultivated taxa in order to provide clarity and stability, and to effectively communicate microbial diversity.
In this Consensus Statement, the authors discuss the issue of naming uncultivated prokaryotic microorganisms, which currently do not have a formal nomenclature system due to a lack of type material or cultured representatives, and propose two recommendations including the recognition of DNA sequences as type material.

資料詳細

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 日付: 2020
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: ISI: 000538968300003
DOI: 10.1038/s41564-020-0733-x
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: NATURE MICROBIOLOGY
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 5 (8) 通巻号: - 開始・終了ページ: 987 - 994 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 2058-5276