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  Gram-negative outer-membrane proteins with multiple β-barrel domains

Solan, R., Pereira, J., Lupas, A., Kolodny, R., & Ben-Tal, N. (2021). Gram-negative outer-membrane proteins with multiple β-barrel domains. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 118(31):. doi:10.1073/pnas.2104059118.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-4BA2-B 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-4BA3-A
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Solan, R, 著者
Pereira, J1, 著者           
Lupas, AN1, 著者           
Kolodny, R, 著者
Ben-Tal, N, 著者
所属:
1Department Protein Evolution, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375791              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Outer-membrane beta barrels (OMBBs) are found in the outer membrane of gram-negative bacteria and eukaryotic organelles. OMBBs fold as antiparallel β-sheets that close onto themselves, forming pores that traverse the membrane. Currently known structures include only one barrel, of 8 to 36 strands, per chain. The lack of multi-OMBB chains is surprising, as most OMBBs form oligomers, and some function only in this state. Using a combination of sensitive sequence comparison methods and coevolutionary analysis tools, we identify many proteins combining multiple beta barrels within a single chain; combinations that include eight-stranded barrels prevail. These multibarrels seem to be the result of independent, lineage-specific fusion and amplification events. The absence of multibarrels that are universally conserved in bacteria with an outer membrane, coupled with their frequent de novo genesis, suggests that their functions are not essential but rather beneficial in specific environments. Adjacent barrels of complementary function within the same chain may allow for functions beyond those of the individual barrels.

資料詳細

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言語:
 日付: 2021-08
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1073/pnas.2104059118
PMID: 34330833
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  その他 : PNAS
  その他 : Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA
  省略形 : Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Washington, D.C. : National Academy of Sciences
ページ: 8 巻号: 118 (31) 通巻号: e2104059118 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0027-8424
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925427230