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  Discovering Temporal Patterns of Differential Gene Expression in Microarray Time Series

Stegle, O., Denby, K., Wild, D., McHattie, S., Mead, A., Ghahramani, Z., et al. (2009). Discovering Temporal Patterns of Differential Gene Expression in Microarray Time Series. In I. Grosse, S. Neumann, S. Posch, F. Schreiber, & P. Stadler (Eds.), German Conference on Bioinformatics 2009 (GCB 2009) (pp. 133-142). Bonn, Germany: Gesellschaft für Informatik.

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Basisdaten

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Genre: Konferenzbeitrag

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Stegle, O1, 2, 3, Autor           
Denby, KJ, Autor
Wild, DL, Autor
McHattie, S, Autor
Mead, A, Autor
Ghahramani, Z, Autor
Borgwardt, KM1, 2, 3, Autor           
Affiliations:
1Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_1497794              
2Former Research Group Machine Learning and Computational Biology, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_2528696              
3Department Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, Max-Planck-Ring 5, 72076 Tübingen, DE, ou_3375790              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: A wealth of time series of microarray measurements have become available over recent years. Several two-sample tests for detecting differential gene expression
in these time series have been defined, but they can only answer the question whether a gene is differentially expressed across the whole time series, not in which intervals it is differentially expressed. In this article, we propose a Gaussian process based approach for studying these dynamics of differential gene expression. In experiments on Arabidopsis thaliana gene expression levels, our novel technique helps us to uncover that the family of WRKY transcription factors appears to be involved in the early response to infection by a fungal pathogen.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2009-09
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: BibTex Citekey: 6295
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Titel: German Conference on Bioinformatics 2009 (GCB 2009)
Veranstaltungsort: Halle, Germany
Start-/Enddatum: 2009-09-28 - 2009-09-30

Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: German Conference on Bioinformatics 2009 (GCB 2009)
Genre der Quelle: Konferenzband
 Urheber:
Grosse, I, Herausgeber
Neumann, S, Herausgeber
Posch, S, Herausgeber
Schreiber, F, Herausgeber
Stadler, PF, Herausgeber
Affiliations:
-
Ort, Verlag, Ausgabe: Bonn, Germany : Gesellschaft für Informatik
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 133 - 142 Identifikator: ISBN: 978-3-88579-251-2