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  Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices

Alseekh, S., Aharoni, A., Brotman, Y., Contrepois, K., D'Auria, J., Ewald, J., et al. (2021). Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nature Methods, 18(7), 747-756. doi:10.1038/s41592-021-01197-1.

Item is

Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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externe Referenz:
https://doi.org/10.1038/s41592-021-01197-1 (Verlagsversion)
Beschreibung:
-
OA-Status:
Hybrid

Urheber

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 Urheber:
Alseekh, S., Autor
Aharoni, A., Autor
Brotman, Y., Autor
Contrepois, K., Autor
D'Auria, J., Autor
Ewald, J., Autor
J, C. Ewald, Autor
Fraser, P. D., Autor
Giavalisco, P., Autor
Hall, R. D., Autor
Heinemann, M., Autor
Link, H.1, 2, Autor           
Luo, J., Autor
Neumann, S., Autor
Nielsen, J., Autor
Perez de Souza, L., Autor
Saito, K., Autor
Sauer, U., Autor
Schroeder, F. C., Autor
Schuster, S., Autor
Siuzdak, G., AutorSkirycz, A., AutorSumner, L. W., AutorSnyder, M. P., AutorTang, H., AutorTohge, T., AutorWang, Y., AutorWen, W., AutorWu, S., AutorXu, G., AutorZamboni, N., AutorFernie, A. R., Autor mehr..
Affiliations:
1Emmy Noether Research Group Dynamic Control of Metabolic Networks, Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Max Planck Society, ou_3266292              
2Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Max Planck Society, Karl-von-Frisch-Strasse 10, D-35043 Marburg, DE, ou_3135468              

Inhalt

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Schlagwörter: Animals Chromatography, Liquid Gas Chromatography-Mass Spectrometry Humans Mass Spectrometry/*methods/standards Metabolomics/*methods/standards Random Allocation Specimen Handling Workflow
 Zusammenfassung: Mass spectrometry-based metabolomics approaches can enable detection and quantification of many thousands of metabolite features simultaneously. However, compound identification and reliable quantification are greatly complicated owing to the chemical complexity and dynamic range of the metabolome. Simultaneous quantification of many metabolites within complex mixtures can additionally be complicated by ion suppression, fragmentation and the presence of isomers. Here we present guidelines covering sample preparation, replication and randomization, quantification, recovery and recombination, ion suppression and peak misidentification, as a means to enable high-quality reporting of liquid chromatography- and gas chromatography-mass spectrometry-based metabolomics-derived data.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2021-07-10
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: Anderer: 34239102
DOI: 10.1038/s41592-021-01197-1
ISSN: 1548-7105 (Electronic)1548-7091 (Linking)
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Nature Methods
  Andere : Nature Methods
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: New York, NY : Nature Publishing Group
Seiten: - Band / Heft: 18 (7) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 747 - 756 Identifikator: ISSN: 1548-7091
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111088195279556