Dual RNA-Seq of Chlamydia and Host Cells

Marsh, JW; Hayward, RJ; Shetty, A; Mahurkar, A; Humphrys, MS; Myers, GSA

doi:10.1007/978-1-4939-9694-0_9

Dual RNA-Seq of Chlamydia and Host Cells

Marsh, J., Hayward, R., Shetty, A., Mahurkar, A., Humphrys, M., & Myers, G. (2019). Dual RNA-Seq of Chlamydia and Host Cells. In Methods in Molecular Biology. US: Springer.

Item is 公開

表示: 全項目非表示: 全項目

基本情報

表示: 非表示:

アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-673E-E 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-673F-D

資料種別: 書籍の一部

ファイル

表示: ファイル

作成者

表示:

非表示:

作成者:
Marsh, JW¹, 著者
Hayward, RJ, 著者
Shetty, A, 著者
Mahurkar, A, 著者
Humphrys, MS, 著者
Myers, GSA, 著者

所属:
1Department Microbiome Science, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375789

内容説明

表示:

非表示:

キーワード: -

要旨: During the infection of a host cell by a bacterial pathogen, a cascading series of gene expression changes occurs as each organism manipulates or responds to the other via defense or survival strategies. Unraveling this complex interplay is key for our understanding of bacterial virulence and host response pathways for the development of novel therapeutics. Dual RNA sequencing (dual RNA-Seq) has recently been developed to simultaneously capture host and bacterial transcriptomes from an infected cell. Leveraging the sensitivity and resolution allowed by RNA-seq, dual RNA-Seq can be applied to any bacteria-eukaryotic host interaction. We pioneered dual RNA-Seq to simultaneously capture Chlamydia and host expression profiles during an in vitro infection as proof of principle. Here we provide a detailed laboratory protocol and bioinformatics analysis guidelines for dual RNA-seq experiments focusing on Chlamydia as the organism of interest.

資料詳細

表示:

非表示:

言語:

日付: 出版: 2019

出版の状態: 出版

ページ: -

出版情報: -

目次: -

査読: -

識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1007/978-1-4939-9694-0_9
PMID: 31385273

学位: -

訴訟

表示:

Project information

表示:

出版物 1

表示:

非表示:

出版物名: Methods in Molecular Biology

その他 : Methods Mol. Biol.

種別: 連載記事

著者・編者:

所属:

出版社, 出版地: US : Springer

ページ: - 巻号: 2042 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1064-3745
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954927725544

出版物 2

表示:

非表示:

出版物名: Chlamydia trachomatis: Methods and Protocols

種別: 書籍

著者・編者:
Brown, AC, 編集者

所属:
-

出版社, 出版地: New York, NY, USA : Humana Press

ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 123 - 135 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISBN: 1-4939-9696-7

アイテム詳細

基本情報

ファイル

関連URL

作成者

内容説明

資料詳細

関連イベント

訴訟

Project information

出版物 1

出版物 2