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  Bio-On-Magnetic-Beads (BOMB): Open platform for high-throughput nucleic acid extraction and manipulation

Oberacker, P., Stepper, P., Bond, D., Höhn, S., Focken, J., Meyer, V., Schelle, L., Sugrue, V., Jeunen, G.-J., Moser, T., Hore, S., von Meyenn, F., Hipp, K., Hore, T., & Jurkowski, T. (2019). Bio-On-Magnetic-Beads (BOMB): Open platform for high-throughput nucleic acid extraction and manipulation. PLoS Biology, 17(1):. doi:10.1371/journal.pbio.3000107.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-69EF-4 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-69F0-1
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Oberacker, P, 著者
Stepper, P, 著者
Bond, DM, 著者
Höhn, S, 著者
Focken, J, 著者
Meyer, V, 著者
Schelle, L, 著者
Sugrue, VJ, 著者
Jeunen, G-J, 著者
Moser, T, 著者
Hore, SR, 著者
von Meyenn, F, 著者
Hipp, K1, 著者           
Hore, TA, 著者
Jurkowski, TP, 著者
所属:
1Electron Microscopy, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375794              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Current molecular biology laboratories rely heavily on the purification and manipulation of nucleic acids. Yet, commonly used centrifuge- and column-based protocols require specialised equipment, often use toxic reagents, and are not economically scalable or practical to use in a high-throughput manner. Although it has been known for some time that magnetic beads can provide an elegant answer to these issues, the development of open-source protocols based on beads has been limited. In this article, we provide step-by-step instructions for an easy synthesis of functionalised magnetic beads, and detailed protocols for their use in the high-throughput purification of plasmids, genomic DNA, RNA and total nucleic acid (TNA) from a range of bacterial, animal, plant, environmental and synthetic sources. We also provide a bead-based protocol for bisulfite conversion and size selection of DNA and RNA fragments. Comparison to other methods highlights the capability, versatility, and extreme cost-effectiveness of using magnetic beads. These open-source protocols and the associated webpage (https://bomb.bio) can serve as a platform for further protocol customisation and community engagement.

資料詳細

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言語:
 日付: 2019-01
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1371/journal.pbio.3000107
PMID: 30629605
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: PLoS Biology
  その他 : PLoS Biol.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: San Francisco, California, US : Public Library of Science
ページ: 16 巻号: 17 (1) 通巻号: e3000107 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1544-9173
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111056649444170