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  A topological refactoring design strategy yields highly stable granulopoietic proteins

Skokowa, J., Hernandez Alvarez, B., Coles, M., Ritter, M., Nasri, M., Haaf, J., Aghaallaei, N., Xu, Y., Mir, P., Krahl, A.-C., Rogers, K., Maksymenko, K., Bajoghli, B., Welte, K., Lupas, A., Müller, P., & ElGamacy, M. (2022). A topological refactoring design strategy yields highly stable granulopoietic proteins. Nature Communications, 13(1):. doi:10.1038/s41467-022-30157-2.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-8443-5 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-3332-3
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Skokowa, J, 著者
Hernandez Alvarez, B, 著者           
Coles, M, 著者           
Ritter, M, 著者
Nasri, M, 著者
Haaf, J, 著者
Aghaallaei, N, 著者
Xu, Y, 著者
Mir, P, 著者
Krahl, A-C, 著者
Rogers, KW1, 著者           
Maksymenko, K1, 著者           
Bajoghli, B, 著者
Welte, K, 著者
Lupas, AN, 著者           
Müller, P1, 著者           
ElGamacy, M1, 著者           
所属:
1Müller Group, Friedrich Miescher Laboratory, Max Planck Society, ou_3008690              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Protein therapeutics frequently face major challenges, including complicated production, instability, poor solubility, and aggregation. De novo protein design can readily address these challenges. Here, we demonstrate the utility of a topological refactoring strategy to design novel granulopoietic proteins starting from the granulocyte-colony stimulating factor (G-CSF) structure. We change a protein fold by rearranging the sequence and optimising it towards the new fold. Testing four designs, we obtain two that possess nanomolar activity, the most active of which is highly thermostable and protease-resistant, and matches its designed structure to atomic accuracy. While the designs possess starkly different sequence and structure from the native G-CSF, they show specific activity in differentiating primary human haematopoietic stem cells into mature neutrophils. The designs also show significant and specific activity in vivo. Our topological refactoring approach is largely independent of sequence or structural context, and is therefore applicable to a wide range of protein targets.

資料詳細

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言語:
 日付: 2022-05
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/s41467-022-30157-2
PMID: 35618709
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Communications
  省略形 : Nat. Commun.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London : Nature Publishing Group
ページ: 17 巻号: 13 (1) 通巻号: 2948 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2041-1723
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2041-1723