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  The genomic basis of parasitism in the Strongyloides clade of nematodes

Hunt, V., Tsai, I., Coghlan, A., Reid, A., Holroyd, N., Foth, B., Tracey, A., Cotton, J., Stanley, E., Beasley, H., Bennett, H., Brooks, K., Harsha, B., Kajitani, R., Kulkarni, A., Harbecke, D., Nagayasu, E., Nichol, S., Ogura, Y., Quail, M., Randle, N., Xia, D., Brattig, N., Soblik, H., Ribeiro, D., Sanchez-Flores, A., Hayashi, T., Itoh, T., Denver, D., Grant, W., Stoltzfus, J., Lok, J., Murayama, H., Wastling, J., Streit, A., Kikuchi, T., Viney, M., & Berriman, M. (2016). The genomic basis of parasitism in the Strongyloides clade of nematodes. Nature Genetics, 48(3), 299-307. doi:10.1038/ng.3495.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-930D-2 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-77F5-8
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Hunt, VL, 著者
Tsai, IJ, 著者
Coghlan, A, 著者
Reid, AJ, 著者
Holroyd, N, 著者
Foth, BJ, 著者
Tracey, A, 著者
Cotton, JA, 著者
Stanley, EJ, 著者
Beasley, H, 著者
Bennett, HM, 著者
Brooks, K, 著者
Harsha, B, 著者
Kajitani, R, 著者
Kulkarni, A1, 2, 著者           
Harbecke, D1, 2, 著者           
Nagayasu, E, 著者
Nichol, S, 著者
Ogura, Y, 著者
Quail, MA, 著者
Randle, N, 著者Xia, D, 著者Brattig, NW, 著者Soblik, H, 著者Ribeiro, DM, 著者Sanchez-Flores, A, 著者Hayashi, T, 著者Itoh, T, 著者Denver, DR, 著者Grant, W, 著者Stoltzfus, JD, 著者Lok, JB, 著者Murayama, H, 著者Wastling, J, 著者Streit, A1, 2, 著者           Kikuchi, T, 著者Viney, M, 著者Berriman, M, 著者 全て表示
所属:
1Department Integrative Evolutionary Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375786              
2Parasitic Nematode Group, Department Integrative Evolutionary Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3507711              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Soil-transmitted nematodes, including the Strongyloides genus, cause one of the most prevalent neglected tropical diseases. Here we compare the genomes of four Strongyloides species, including the human pathogen Strongyloides stercoralis, and their close relatives that are facultatively parasitic (Parastrongyloides trichosuri) and free-living (Rhabditophanes sp. KR3021). A significant paralogous expansion of key gene families--families encoding astacin-like and SCP/TAPS proteins--is associated with the evolution of parasitism in this clade. Exploiting the unique Strongyloides life cycle, we compare the transcriptomes of the parasitic and free-living stages and find that these same gene families are upregulated in the parasitic stages, underscoring their role in nematode parasitism.

資料詳細

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言語:
 日付: 2016-03
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/ng.3495
PMID: 26829753
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Genetics
  その他 : Nature Genet.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature America, Inc.
ページ: - 巻号: 48 (3) 通巻号: - 開始・終了ページ: 299 - 307 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609