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  AI-based structure prediction empowers integrative structural analysis of human nuclear pores

Mosalaganti, S., Obarska-Kosinska, A., Siggel, M., Taniguchi, R., Turoňová, B., Zimmerli, C. E., Buczak, K., Schmidt, F. H., Margiotta, E., Mackmull, M.-T., Hagen, W. J. H., Hummer, G., Kosinski, J., & Beck, M. (2022). AI-based structure prediction empowers integrative structural analysis of human nuclear pores. Science, 376(6598):. doi:10.1126/science.abm9506.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-9651-1 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-9598-0
資料種別: 学術論文

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abm9506_ArticleContent_CombinedFULL.pdf (全文テキスト(全般)), 8MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-CB2B-2
ファイル名:
abm9506_ArticleContent_CombinedFULL.pdf
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-
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-
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作成者

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 作成者:
Mosalaganti, Shyamal1, 2, 3, 著者           
Obarska-Kosinska, Agnieszka1, 4, 著者           
Siggel, Marc4, 5, 6, 著者           
Taniguchi, Reiya1, 2, 著者           
Turoňová, Beata1, 2, 著者           
Zimmerli, Christian E.1, 2, 著者           
Buczak, Katarzyna2, 著者
Schmidt, Florian H.2, 著者
Margiotta, Erica1, 2, 著者           
Mackmull, Marie-Therese2, 著者
Hagen, Wim J. H.2, 著者
Hummer, Gerhard5, 7, 著者                 
Kosinski, Jan2, 4, 6, 著者
Beck, Martin1, 2, 著者                 
所属:
1Department of Molecular Sociology, Max Planck Institute of Biophysics, Max Planck Society, ou_3040395              
2Structural and Computational Biology Unit, European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Germany, ou_persistent22              
3Life Sciences Institute and Department of Cell and Developmental Biology, University of Michigan, Ann Arbor, USA, ou_persistent22              
4European Molecular Biology Laboratory Hamburg, Hamburg, Germany, ou_persistent22              
5Department of Theoretical Biophysics, Max Planck Institute of Biophysics, Max Planck Society, ou_2068292              
6Centre for Structural Systems Biology, Hamburg, Germany, ou_persistent22              
7Institute of Biophysics, Goethe University Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Nuclear pore complexes (NPCs) mediate nucleocytoplasmic transport. Their intricate 120-megadalton architecture remains incompletely understood. Here, we report a 70-megadalton model of the human
NPC scaffold with explicit membrane and in multiple conformational states. We combined artificial intelligence (AI)–based structure prediction with in situ and in cellulo cryo–electron tomography and integrative modeling. We show that linker nucleoporins spatially organize the scaffold within and across subcomplexes to establish the higher-order structure. Microsecond-long molecular dynamics simulations
suggest that the scaffold is not required to stabilize the inner and outer nuclear membrane fusion but rather widens the central pore. Our work exemplifies how AI-based modeling can be integrated with
in situ structural biology to understand subcellular architecture across spatial organization levels.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2021-10-242022-04-222022-06-102022-06-10
 出版の状態: 出版
 ページ: 14
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1126/science.abm9506
BibTex参照ID: mosalaganti_ai-based_2022
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Science
  省略形 : Science
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Washington, D.C. : American Association for the Advancement of Science
ページ: - 巻号: 376 (6598) 通巻号: eabm9506 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0036-8075
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/991042748276600_1