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  Self-supervised machine learning pushes the sensitivity limit in label-free detection of single proteins below 10 kDa

Dahmardeh, M., Mirzaalian Dastjerdi, H., Mazal, H., Köstler, H., & Sandoghdar, V. (2023). Self-supervised machine learning pushes the sensitivity limit in label-free detection of single proteins below 10 kDa. Nature Methods, 20, 442-447. doi:10.1038/s41592-023-01778-2.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-A243-3 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-04FE-0
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Dahmardeh, Mahyar1, 2, 著者           
Mirzaalian Dastjerdi, Houman1, 著者           
Mazal, Hisham1, 2, 著者           
Köstler, Harald3, 著者
Sandoghdar, Vahid1, 2, 3, 著者           
所属:
1Sandoghdar Division, Max Planck Institute for the Science of Light, Max Planck Society, ou_2364722              
2Max-Planck-Zentrum für Physik und Medizin, Max Planck Institute for the Science of Light, Max Planck Society, ou_3164414              
3Friedrich-Alexander-Univerisität Erlangen-Nürnberg, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Interferometric scattering (iSCAT) microscopy is a label-free optical method capable of detecting single proteins, localizing
their binding positions with nanometer precision, and measuring their mass. In the ideal case, iSCAT is limited by shot noise
so that collection of more photons should allow its detection sensitivity to biomolecules of arbitrarily low mass. However, a
number of technical noise sources combined with speckle-like background fluctuations have restricted the detection limit in
iSCAT. Here, we show that an unsupervised machine learning isolation forest algorithm for anomaly detection pushes the
mass sensitivity limit by a factor of four to below 10 kDa. We implement this scheme both with a user-defined feature matrix
and a self-supervised FastDVDNet and validate our results with correlative fluorescence images recorded in total internal
reflection mode. Our work opens the door to the optical detection of small traces of disease markers such as alpha-synuclein,
chemokines, and cytokines.

資料詳細

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言語:
 日付: 2023-02-27
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/s41592-023-01778-2
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Methods
  その他 : Nature Methods
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature Publishing Group
ページ: - 巻号: 20 通巻号: - 開始・終了ページ: 442 - 447 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1548-7091
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111088195279556