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  Transposable elements promote the evolution of genome streamlining

van Dijk, B., Bertels, F., Stolk, L., Takeuchi, N., & Rainey, P. B. (2022). Transposable elements promote the evolution of genome streamlining. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences, 377(1842):. doi:10.1098/rstb.2020.0477.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-A325-4 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-FAAF-6
資料種別: 学術論文

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:
rstb.2020.0477.pdf (出版社版), 6MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-A327-2
ファイル名:
rstb.2020.0477.pdf
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Gold
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application/pdf / [MD5]
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作成者

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 作成者:
van Dijk, Bram1, 著者           
Bertels, Frederic2, 著者           
Stolk, Lianne, 著者
Takeuchi, Nobuto, 著者
Rainey, Paul B.1, 著者                 
所属:
1Department Microbial Population Biology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_2421699              
2Research Group Microbial Molecular Evolution, Department Microbial Population Biology, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_2497692              

内容説明

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キーワード: ineage selection, non-transitive interactions,sex, horizontal gene transfer, spatial structure,altruism
 要旨: Eukaryotes and prokaryotes have distinct genome architectures, withmarked differences in genome size, the ratio of coding/non-coding DNA,and the abundance of transposable elements (TEs). As TEs replicate inde-pendently of their hosts, the proliferation of TEs is thought to have drivengenome expansion in eukaryotes. However, prokaryotes also have TEs inintergenic spaces, so why do prokaryotes have small, streamlined genomes?Using anin silicomodel describing the genomes of single-celled asexualorganisms that coevolve with TEs, we show that TEs acquired from theenvironment by horizontal gene transfer can promote the evolution ofgenome streamlining. The process depends on local interactions and isunderpinned by rock–paper–scissors dynamics in which populations ofcells with streamlined genomes beat TEs, which beat non-streamlinedgenomes, which beat streamlined genomes, in continuous and repeatingcycles. Streamlining is maladaptive to individual cells, but improves lineageviability by hindering the proliferation of TEs. Streamlining does not evolvein sexually reproducing populations because recombination partially freesTEs from the deleterious effects they cause.This article is part of the theme issue‘The secret lives of microbial mobilegenetic elements’.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2021-05-292021-08-302021-11-292022-01
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1098/rstb.2020.0477
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B: Biological Sciences
  その他 : Philosophical Transactions B
  省略形 : Phil. Trans. R. Soc. B
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London : Royal Society
ページ: - 巻号: 377 (1842) 通巻号: 20200477 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0962-8436
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/963017382021_1