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  Genome-wide binding-site analysis of REVOLUTA reveals a link between leaf patterning and light-mediated growth responses

Brandt, R., Salla-Martret, M., Bou-Torrent, J., Musielak, T., Stahl, M., Lanz, C., Ott, F., Schmid, M., Greb, T., Schwarz, M., Choi, S.-B., Barton, M., Reinhart, B., Liu, T., Quint, M., Palauqui, J.-C., Martínez-García, J., & Wenkel, S. (2012). Genome-wide binding-site analysis of REVOLUTA reveals a link between leaf patterning and light-mediated growth responses. The Plant Journal, 72(1), 31-42. doi:10.1111/j.1365-313X.2012.05049.x.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-B63D-5 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-B63E-4
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Brandt, R, 著者
Salla-Martret, M, 著者
Bou-Torrent, J, 著者
Musielak, T, 著者           
Stahl, M, 著者
Lanz, C1, 著者           
Ott, F1, 著者           
Schmid, M1, 著者           
Greb, T, 著者
Schwarz, M, 著者
Choi, S-B, 著者
Barton, MK, 著者
Reinhart, BJ, 著者
Liu, T, 著者
Quint, M, 著者
Palauqui, J-C, 著者
Martínez-García, JF, 著者
Wenkel, S, 著者
所属:
1Department Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375790              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Unlike the situation in animals, the final morphology of the plant body is highly modulated by the environment. During Arabidopsis development, intrinsic factors provide the framework for basic patterning processes. CLASS III HOMEODOMAIN LEUCINE ZIPPER (HD-ZIPIII) transcription factors are involved in embryo, shoot and root patterning. During vegetative growth HD-ZIPIII proteins control several polarity set-up processes such as in leaves and the vascular system. We have identified several direct target genes of the HD-ZIPIII transcription factor REVOLUTA (REV) using a chromatin immunoprecipitation/DNA sequencing (ChIP-Seq) approach. This analysis revealed that REV acts upstream of auxin biosynthesis and affects directly the expression of several class II HD-ZIP transcription factors that have been shown to act in the shade-avoidance response pathway. We show that, as well as involvement in basic patterning, HD-ZIPIII transcription factors have a critical role in the control of the elongation growth that is induced when plants experience shade. Leaf polarity is established by the opposed actions of HD-ZIPIII and KANADI transcription factors. Finally, our study reveals that the module that consists of HD-ZIPIII/KANADI transcription factors controls shade growth antagonistically and that this antagonism is manifested in the opposed regulation of shared target genes.

資料詳細

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言語:
 日付: 2012-10
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1111/j.1365-313X.2012.05049.x
PMID: 22578006
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: The Plant Journal
  その他 : Plant J.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Blackwell Science
ページ: - 巻号: 72 (1) 通巻号: - 開始・終了ページ: 31 - 42 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0960-7412
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925579095_1