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  Nuclear basket protein ZC3HC1 and its yeast homolog Pml39p feature an evolutionary conserved bimodular construction essential for initial binding to NPC-anchored homologs of scaffold protein TPR

Gunkel, P., Iino, H., Krull, S., & Cordes, V. (2022). Nuclear basket protein ZC3HC1 and its yeast homolog Pml39p feature an evolutionary conserved bimodular construction essential for initial binding to NPC-anchored homologs of scaffold protein TPR. bioRxiv. doi:10.1101/2022.09.10.507405.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-38CF-E 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-D426-A
資料種別: Preprint

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:
2022.09.10.507405v1.full.pdf (プレプリント), 6MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-38D1-A
ファイル名:
2022.09.10.507405v1.full.pdf
説明:
-
OA-Status:
Green
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-

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作成者

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 作成者:
Gunkel, Philip1, 著者           
Iino, Haruki1, 著者
Krull, S.1, 著者           
Cordes, V.1, 著者           
所属:
1Department of Cellular Logistics, Max Planck Institute for Multidisciplinary Sciences, Max Planck Society, ou_3350135              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Proteins ZC3HC1 and TPR are construction elements of the nuclear pore complex (NPC)-attached nuclear basket (NB). NB-location of ZC3HC1 depends on TPR already occurring NPC-anchored, whereas additional TPR polypeptides are appended to the NB by ZC3HC1. The current study examined the molecular properties of ZC3HC1 that enable it to bind to the NB and TPR. We report the identification and definition of a nuclear basket-interaction domain (NuBaID) of HsZC3HC1 comprising two similarly built modules, both essential for the binding to the NB’s NPC-anchored HsTPR. Furthermore, we describe such a bimodular construction as evolutionarily conserved and exemplify the kinship of HsZC3HC1 by the NB- and DdTPR-interacting homolog of Dictyostelium discoideum and by characterizing protein Pml39 as the ZC3HC1 homolog in Saccharomyces cerevisiae. Among several properties shared by the different species’ homologs, we unveil the integrity of the bimodular NuBaID of ScPml39p as being essential for binding to the yeast’s NBs and its TPR homologs ScMlp1p and ScMlp2p, and we further present Pml39p as enabling interlinkage of Mlp1p subpopulations. In addition to phyla-specific features, we delineate the three species’ common NuBaID as the characterizing structural entity of a one-of-a-kind protein found not in all but likely most taxa of the eukaryotic realm.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2022-09-10
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読なし
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1101/2022.09.10.507405
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: bioRxiv
種別: Web Page
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -