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  LRPPRC-mediated folding of the mitochondrial transcriptome

Siira, S. J., Spahr, H., Shearwood, A. J., Ruzzenente, B., Larsson, N., Rackham, O., & Filipovska, A. (2017). LRPPRC-mediated folding of the mitochondrial transcriptome. Nat Commun, 8(1), 1532. doi:10.1038/s41467-017-01221-z.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-4A88-9 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-4A89-8
資料種別: 学術論文

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URL:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29146908 (全文テキスト(全般))
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-
OA-Status:
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作成者

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 作成者:
Siira, S. J., 著者
Spahr, H.1, 著者           
Shearwood, A. J., 著者
Ruzzenente, B.1, 著者           
Larsson, N.G.1, 著者           
Rackham, O., 著者
Filipovska, A., 著者
所属:
1Department Larsson - Mitochondrial Biology, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Max Planck Society, ou_1942286              

内容説明

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キーワード: Animals Binding Sites Fibroblasts Genome, Mitochondrial/physiology Humans Male Mice, Inbred C57BL Mice, Knockout Mitochondria/*physiology Molecular Chaperones/physiology Neoplasm Proteins/*physiology Polyadenylation/physiology Protein Binding/physiology Protein Biosynthesis/physiology Protein Footprinting/methods RNA Folding/*physiology RNA Stability/physiology RNA, Messenger/genetics/metabolism RNA-Binding Proteins/*physiology Recombinant Proteins/genetics/metabolism Sequence Analysis, RNA/methods Transcriptome/*physiology
 要旨: The expression of the compact mammalian mitochondrial genome requires transcription, RNA processing, translation and RNA decay, much like the more complex chromosomal systems, and here we use it as a model system to understand the fundamental aspects of gene expression. Here we combine RNase footprinting with PAR-CLIP at unprecedented depth to reveal the importance of RNA-protein interactions in dictating RNA folding within the mitochondrial transcriptome. We show that LRPPRC, in complex with its protein partner SLIRP, binds throughout the mitochondrial transcriptome, with a preference for mRNAs, and its loss affects the entire secondary structure and stability of the transcriptome. We demonstrate that the LRPPRC-SLIRP complex is a global RNA chaperone that stabilizes RNA structures to expose the required sites for translation, stabilization, and polyadenylation. Our findings reveal a general mechanism where extensive RNA-protein interactions ensure that RNA is accessible for its biological functions.

資料詳細

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言語:
 日付: 2017-11-162017-11-18
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): その他: 29146908
DOI: 10.1038/s41467-017-01221-z
ISSN: 2041-1723 (Electronic)2041-1723 (Linking)
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nat Commun
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 8 (1) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1532 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -