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  Genome-scale RNAi profiling of cell division in human tissue culture cells

Kittler, R., Pelletier, L., Heninger, A. K., Slabicki, M., Theis, M., Miroslaw, L., Poser, I., Lawo, S., Grabner, H., Kozak, K., Wagner, J., Surendranath, V., Richter, C., Bowen, W., Jackson, A. L., Habermann, B., Hyman, A. A., & Buchholz, F. (2007). Genome-scale RNAi profiling of cell division in human tissue culture cells. Nat Cell Biol, 9(12), 1401-12. doi:10.1038/ncb1659.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-838F-0 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-8390-D
資料種別: 学術論文

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URL:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17994010 (全文テキスト(全般))
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 作成者:
Kittler, R., 著者
Pelletier, L., 著者
Heninger, A. K., 著者
Slabicki, M., 著者
Theis, M., 著者
Miroslaw, L., 著者
Poser, I., 著者
Lawo, S.1, 著者           
Grabner, H., 著者
Kozak, K., 著者
Wagner, J., 著者
Surendranath, V., 著者
Richter, C., 著者
Bowen, W., 著者
Jackson, A. L., 著者
Habermann, B., 著者
Hyman, A. A., 著者
Buchholz, F., 著者
所属:
1CRISPR Screening, Core Facilities, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Max Planck Society, ou_3394014              

内容説明

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キーワード: Cell Division/*physiology Gene Expression Profiling *Genome, Human HeLa Cells Humans *RNA Interference RNA, Small Interfering/metabolism
 要旨: Cell division is fundamental for all organisms. Here we report a genome-scale RNA-mediated interference screen in HeLa cells designed to identify human genes that are important for cell division. We have used a library of endoribonuclease-prepared short interfering RNAs for gene silencing and have used DNA content analysis to identify genes that induced cell cycle arrest or altered ploidy on silencing. Validation and secondary assays were performed to generate a nine-parameter loss-of-function phenoprint for each of the genes. These phenotypic signatures allowed the assignment of genes to specific functional classes by combining hierarchical clustering, cross-species analysis and proteomic data mining. We highlight the richness of our dataset by ascribing novel functions to genes in mitosis and cytokinesis. In particular, we identify two evolutionarily conserved transcriptional regulatory networks that govern cytokinesis. Our work provides an experimental framework from which the systematic analysis of novel genes necessary for cell division in human cells can begin.

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 日付: 2007-122007-11-13
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): その他: 17994010
DOI: 10.1038/ncb1659
ISSN: 1465-7392 (Print)1465-7392 (Linking)
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nat Cell Biol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 9 (12) 通巻号: - 開始・終了ページ: 1401 - 12 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -