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  Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing.

Dahn, H. A., Mountcastle, J., Balacco, J., Winkler, S., Bista, I., Schmitt, A. D., Pettersson, O. V., Formenti, G., Oliver, K., Smith, M., Tan, W., Kraus, A., Mac, S., Komoroske, L. M., Lama, T. M., Crawford, A. J., Murphy, R. F., Brown, S., Scott, A. F., Morin, P. A., Jarvis, E. D., & Fedrigo, O. (2022). Benchmarking ultra-high molecular weight DNA preservation methods for long-read and long-range sequencing. GigaScience, 11:. doi:10.1093/gigascience/giac068.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-7445-4 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-7446-3
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Dahn, Hollis A, 著者
Mountcastle, Jacquelyn, 著者
Balacco, Jennifer, 著者
Winkler, Sylke1, 著者           
Bista, Iliana, 著者
Schmitt, Anthony D, 著者
Pettersson, Olga Vinnere, 著者
Formenti, Giulio, 著者
Oliver, Karen, 著者
Smith, Michelle, 著者
Tan, Wenhua, 著者
Kraus, Anne, 著者
Mac, Stephen, 著者
Komoroske, Lisa M, 著者
Lama, Tanya M, 著者
Crawford, Andrew J, 著者
Murphy, Robert F, 著者
Brown, Samara, 著者
Scott, Alan F, 著者
Morin, Phillip A, 著者
Jarvis, Erich D, 著者Fedrigo, Olivier, 著者 全て表示
所属:
1Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Max Planck Society, ou_2340692              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Studies in vertebrate genomics require sampling from a broad range of tissue types, taxa, and localities. Recent advancements in long-read and long-range genome sequencing have made it possible to produce high-quality chromosome-level genome assemblies for almost any organism. However, adequate tissue preservation for the requisite ultra-high molecular weight DNA (uHMW DNA) remains a major challenge. Here we present a comparative study of preservation methods for field and laboratory tissue sampling, across vertebrate classes and different tissue types.

資料詳細

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言語:
 日付: 2022-08-10
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/gigascience/giac068
その他: cbg-8432
PMID: 35946988
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: GigaScience
  その他 : GigaScience
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 11 通巻号: giac068 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -