Automatic Single-Cell Segmentation and Tracking of Bacterial Cells in 
Fluorescence Microscopy Images

Liluashvili, Vaja; Bergeest, Jan-Philip; Harder, Nathalie; Ziesack, Marika; Mutlu, Alper; Bischofs, Ilka B.; Rohr, Karl

doi:10.1007/978-3-662-46224-9_42

Automatic Single-Cell Segmentation and Tracking of Bacterial Cells in Fluorescence Microscopy Images

Liluashvili, V., Bergeest, J.-P., Harder, N., Ziesack, M., Mutlu, A., Bischofs, I. B., & Rohr, K. (2015). Automatic Single-Cell Segmentation and Tracking of Bacterial Cells in Fluorescence Microscopy Images. In BILDVERARBEITUNG FUR DIE MEDIZIN 2015: ALGORITHMEN - SYSTEME - ANWENDUNGEN (pp. 239-244).

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-91AB-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-91AC-E

資料種別: 会議論文

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Liluashvili, Vaja¹, 著者
Bergeest, Jan-Philip¹, 著者
Harder, Nathalie¹, 著者
Ziesack, Marika¹, 著者
Mutlu, Alper¹, 著者
Bischofs, Ilka B.², 著者
Rohr, Karl¹, 著者

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1external, ou_persistent22
2Center for Molecular Biology (ZMBH) and Center for the Quantitative Analysis of Molecular and Cellular Biosystems (BioQuant), University of Heidelberg, Germany, ou_persistent22

内容説明

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キーワード: -

要旨: Automatic single-cell image analysis allows gaining deeper insights into biological processes. We present an approach for single-cell segmentation and tracking of bacterial cells in time-lapse microscopy image data. For cell segmentation we use linear feature detection and a probability map combined with schemes for cell splitting. For cell tracking we propose an approach based on the maximal overlapping area between cells, which is robust regarding cell rotation and accurately detects cell divisions. Our approach was successfully applied to segment and track cells in time-lapse images of the life cycle of Bacillus subtilis. We also quantitatively evaluated the performance of the segmentation and tracking approaches.

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日付: 出版: 2015

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識別子（DOI, ISBNなど）: ISI: 000384521700042
DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_42

学位: -

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出版物名: BILDVERARBEITUNG FUR DIE MEDIZIN 2015: ALGORITHMEN - SYSTEME - ANWENDUNGEN

種別: 会議論文集

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出版社, 出版地: -

ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 239 - 244 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISBN: 978-3-662-46224-9; 978-3-662-46223-2

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