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  AraPheno: a public database for Arabidopsis thaliana phenotypes

Seren, Ü., Grimm, D., Fitz, J., Weigel, D., Nordborg, M., Borgwardt, K., & Korte, A. (2017). AraPheno: a public database for Arabidopsis thaliana phenotypes. Nucleic Acids Research, 45(D1), D1054-D1059. doi:10.1093/nar/gkw986.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-F290-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000C-F291-E
資料種別: 学術論文
その他のタイトル : AraPheno

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-
OA-Status:
Not specified

作成者

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 作成者:
Seren, Ümit, 著者
Grimm, Dominik, 著者
Fitz, Joffrey, 著者
Weigel, Detlef, 著者
Nordborg, Magnus, 著者
Borgwardt, Karsten1, 著者                 
Korte, Arthur, 著者
所属:
1ETH Zürich, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Natural genetic variation makes it possible to discover evolutionary changes that have been maintained in a population because they are advantageous. To understand genotype–phenotype relationships and to investigate trait architecture, the existence of both high-resolution genotypic and phenotypic data is necessary. Arabidopsis thaliana is a prime model for these purposes. This herb naturally occurs across much of the Eurasian continent and North America. Thus, it is exposed to a wide range of environmental factors and has been subject to natural selection under distinct conditions. Full genome sequencing data for more than 1000 different natural inbred lines are available, and this has encouraged the distributed generation of many types of phenotypic data. To leverage these data for meta analyses, AraPheno (https://arapheno.1001genomes.org) provide a central repository of population-scale phenotypes for A. thaliana inbred lines. AraPheno includes various features to easily access, download and visualize the phenotypic data. This will facilitate a comparative analysis of the many different types of phenotypic data, which is the base to further enhance our understanding of the genotype–phenotype map.

資料詳細

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言語:
 日付: 2017-01-042017
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/nar/gkw986
ISSN: 0305-1048
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Nucleic Acids Research
  出版物の別名 : Nucleic Acids Research
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 45 (D1) 通巻号: - 開始・終了ページ: D1054 - D1059 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -