Large-scale invasion of unicellular eukaryotic genomes by integrating DNA 
viruses

Bellas, Christopher; Hackl, Thomas; Plakolb, Marie-Sophie; Koslová, Anna; Fischer, Matthias G.; Sommaruga, Ruben

doi:10.1073/pnas.2300465120

Large-scale invasion of unicellular eukaryotic genomes by integrating DNA viruses

Bellas, C., Hackl, T., Plakolb, M.-S., Koslová, A., Fischer, M. G., & Sommaruga, R. (2023). Large-scale invasion of unicellular eukaryotic genomes by integrating DNA viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 120(16):, pp. 1-10. doi:10.1073/pnas.2300465120.

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資料種別: 学術論文

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Plakolb, Marie-Sophie, 著者
Koslová, Anna¹, 著者
Fischer, Matthias G.¹, 著者
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所属:
1Department of Biomolecular Mechanisms, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_1497700

内容説明

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キーワード: Polinton; endogenous; protist; virophage; virus

要旨: Eukaryotic genomes contain a variety of endogenous viral elements (EVEs), which are mostly derived from RNA and ssDNA viruses that are no longer functional and are considered to be "genomic fossils." Genomic surveys of EVEs, however, are strongly biased toward animals and plants, whereas protists, which represent the majority of eukaryotic diversity, remain poorly represented. Here, we show that protist genomes harbor tens to thousands of diverse, ~14 to 40 kbp long dsDNA viruses. These EVEs, composed of virophages, Polinton-like viruses, and related entities, have remained hitherto hidden owing to poor sequence conservation between virus groups and their repetitive nature that precluded accurate short-read assembly. We show that long-read sequencing technology is ideal for resolving virus insertions. Many protist EVEs appear intact, and most encode integrases, which suggests that they have actively colonized hosts across the tree of eukaryotes. We also found evidence for gene expression in host transcriptomes and that closely related virophage and Polinton-like virus genomes are abundant in viral metagenomes, indicating that many EVEs are probably functional viruses.

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言語: eng - English

日付: 投稿: 2023-01-12受理: 2023-03-20オンライン出版: 2023-04-10出版: 2023-04-18

出版の状態: 出版

ページ: 10

出版情報: -

目次: -

査読: 査読あり

識別子（DOI, ISBNなど）: URI: https://europepmc.org/article/med/37036967
URI: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37036967/
DOI: 10.1073/pnas.2300465120

学位: -

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出版物名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

その他 : PNAS

その他 : Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA

省略形 : Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

種別: 学術雑誌

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出版社, 出版地: Washington, D.C. : National Academy of Sciences

ページ: - 巻号: 120 (16) 通巻号: e2300465120 開始・終了ページ: 1 - 10 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: ISSN: 0027-8424
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925427230

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