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  Origin and Evolution of the Kiwifruit Canker Pandemic

McCann, H., Li, L., Liu, Y., Li, D., Pan, H., Zhong, C., Rikkerink, E., Templeton, M., Straub, C., Colombi, E., Rainey, P., & Huang, H. (2017). Origin and Evolution of the Kiwifruit Canker Pandemic. Genome Biology and Evolution, 9(4), 932-944. doi:10.1093/gbe/evx055.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-0CA4-D 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-0CA5-C
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
McCann, HC1, 著者                 
Li, L, 著者
Liu, Y, 著者
Li, D, 著者
Pan, H, 著者
Zhong, C, 著者
Rikkerink, EHA, 著者
Templeton, MD, 著者
Straub, C, 著者
Colombi, E, 著者
Rainey, PB, 著者
Huang, H, 著者
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Recurring epidemics of kiwifruit (Actinidia spp.) bleeding canker disease are caused by Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa). In order to strengthen understanding of population structure, phylogeography, and evolutionary dynamics, we isolated Pseudomonas from cultivated and wild kiwifruit across six provinces in China. Based on the analysis of 80 sequenced Psa genomes, we show that China is the origin of the pandemic lineage but that strain diversity in China is confined to just a single clade. In contrast, Korea and Japan harbor strains from multiple clades. Distinct independent transmission events marked introduction of the pandemic lineage into New Zealand, Chile, Europe, Korea, and Japan. Despite high similarity within the core genome and minimal impact of within-clade recombination, we observed extensive variation even within the single clade from which the global pandemic arose.

資料詳細

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言語:
 日付: 2017-04
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/gbe/evx055
PMID: 28369338
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Genome Biology and Evolution
  その他 : GBE
  省略形 : Genome Biol Evol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Oxford Univ. Press
ページ: - 巻号: 9 (4) 通巻号: - 開始・終了ページ: 932 - 944 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1759-6653
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1759-6653