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  Hijacking of transcriptional condensates by endogenous retroviruses

Asimi, V., Kumar, A. S., Niskanen, H., Riemenschneider, C., Hetzel, S., Naderi, J., Fasching, N., Popitsch, N., Du, M., Kretzmer, H., Smith, Z. D., Weigert, R., Walther, M., Mamde, S., Meierhofer, D., Wittler, L., Buschow, R., Timmermann, B., Cissé, I. I., Ameres, S. L., Meissner, A., & Hnisz, D. (2022). Hijacking of transcriptional condensates by endogenous retroviruses. Nature Genetics, 54, 1238-1247. doi:10.1038/s41588-022-01132-w.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-15F9-3 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-15FA-2
資料種別: 学術論文

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:
10.1038_s41588-022-01132-w.pdf (出版社版), 28MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-15FB-1
ファイル名:
10.1038_s41588-022-01132-w.pdf
説明:
-
OA-Status:
Not specified
閲覧制限:
公開
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
2022
著作権情報:
The Author(s)

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-
OA-Status:
Not specified

作成者

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 作成者:
Asimi, Vahid1, 著者
Kumar, Abhishek Sampath1, 著者
Niskanen, Henri1, 著者
Riemenschneider, Christina1, 著者
Hetzel, Sara1, 著者
Naderi, Julian1, 著者
Fasching, Nina1, 著者
Popitsch, Niko1, 著者
Du, Manyu2, 著者
Kretzmer, Helene1, 著者
Smith, Zachary D1, 著者
Weigert, Raha1, 著者
Walther, Maria1, 著者
Mamde, Sainath1, 著者
Meierhofer, David1, 著者
Wittler, Lars1, 著者
Buschow, René1, 著者
Timmermann, Bernd1, 著者
Cissé, Ibrahim Ibrahim2, 著者           
Ameres, Stefan L1, 著者
Meissner, Alexander1, 著者Hnisz, Denes1, 著者 全て表示
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Department of Biological Physics, Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Max Planck Society, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Most endogenous retroviruses (ERVs) in mammals are incapable of retrotransposition; therefore, why ERV derepression is associated with lethality during early development has been a mystery. Here, we report that rapid and selective degradation of the heterochromatin adapter protein TRIM28 triggers dissociation of transcriptional condensates from loci encoding super-enhancer (SE)-driven pluripotency genes and their association with transcribed ERV loci in murine embryonic stem cells. Knockdown of ERV RNAs or forced expression of SE-enriched transcription factors rescued condensate localization at SEs in TRIM28-degraded cells. In a biochemical reconstitution system, ERV RNA facilitated partitioning of RNA polymerase II and the Mediator coactivator into phase-separated droplets. In TRIM28 knockout mouse embryos, single-cell RNA-seq analysis revealed specific depletion of pluripotent lineages. We propose that coding and noncoding nascent RNAs, including those produced by retrotransposons, may facilitate 'hijacking' of transcriptional condensates in various developmental and disease contexts.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2022-07-21
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/s41588-022-01132-w
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Genetics
  その他 : Nature Genet.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature America, Inc.
ページ: - 巻号: 54 通巻号: - 開始・終了ページ: 1238 - 1247 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609