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  Isolation of supernumerary mini-chromosomes from fungi for enrichment sequencing

Langner, T., Harant, A., & Kamoun, S. (2019). Isolation of supernumerary mini-chromosomes from fungi for enrichment sequencing.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-65F8-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-65F9-9
資料種別: Preprint

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作成者

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 作成者:
Langner, T1, 著者                 
Harant, A, 著者
Kamoun, S, 著者
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Fungal genomes are highly dynamic and often contain supernumerary mini-chromosomes. However, our knowledge about the role of mini-chromosomes in dynamic genome rearrangements and evolution is scarce. Mini-chromosomes are usually smaller then core-chromosomes and are variable in size and numbers between individuals of a species. Mini-chromosome occurence in fungi is well documented since decades, but many genomic projects have neglected them, mainly because it was technically challenging to identify them in whole genome assemblies.
Here we present a protocol for isolation of mini-chromosomes for enrichment sequencing. This allows identification of mini-chromosomes in whole genome assemblies and thus comparative genomics analyses of core- and mini-chromosomes.

資料詳細

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言語:
 日付: 2019-12
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.17504/protocols.io.9t7h6rn
 学位: -

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