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  Driving forces behind phase separation of the carboxy-terminal domain of RNA polymerase II

Flores-Solis, D., Lushpinskaia, I. P., Polyansky, A. A., Changiarath, A., Boehning, M., Mirkovic, M., Walshe, J., Pietrek, L. M., Cramer, P., Stelzl, L. S., Zagrovic, B., & Zweckstetter, M. (2023). Driving forces behind phase separation of the carboxy-terminal domain of RNA polymerase II. Nature Communications, 14:. doi:10.1038/s41467-023-41633-8.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-BD4E-8 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-BD4F-7
資料種別: 学術論文

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s41467-023-41633-8.pdf (全文テキスト(全般)), 5MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-BD50-4
ファイル名:
s41467-023-41633-8.pdf
説明:
-
OA-Status:
Not specified
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Flores-Solis, David1, 著者
Lushpinskaia, Irina P.1, 著者
Polyansky, Anton A.2, 3, 著者
Changiarath, Arya4, 5, 著者
Boehning, Marc6, 著者
Mirkovic, Milana2, 3, 著者
Walshe, James6, 著者
Pietrek, Lisa M.7, 著者                 
Cramer, Patrick6, 著者
Stelzl, Lukas S.4, 5, 8, 著者
Zagrovic, Bojan2, 3, 著者
Zweckstetter, Markus1, 9, 著者
所属:
1German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Göttingen, Germany, ou_persistent22              
2Max Perutz Labs, Vienna Biocenter Campus (VBC), Vienna, Austria, ou_persistent22              
3University of Vienna, Center for Molecular Biology, Department of Structural and Computational Biology, Vienna, Austria, ou_persistent22              
4Faculty of Biology, Johannes Gutenberg University Mainz (JGU), Mainz, Germany, ou_persistent22              
5KOMET1, Institute of Physics, Johannes Gutenberg University Mainz (JGU), Mainz, Germany, ou_persistent22              
6Department of Molecular Biology, Max Planck Institute for Multidisciplinary Sciences, Göttingen, Germany, ou_persistent22              
7Department of Theoretical Biophysics, Max Planck Institute of Biophysics, Max Planck Society, ou_2068292              
8Institute of Molecular Biology (IMB), Mainz, Germany, ou_persistent22              
9Department of NMR-based Structural Biology, Max Planck Institute for Multidisciplinary Sciences, Göttingen, Germany , ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: Proteins, Solution-state NMR
 要旨: Eukaryotic gene regulation and pre-mRNA transcription depend on the carboxy-terminal domain (CTD) of RNA polymerase (Pol) II. Due to its highly repetitive, intrinsically disordered sequence, the CTD enables clustering and phase separation of Pol II. The molecular interactions that drive CTD phase separation and Pol II clustering are unclear. Here, we show that multivalent interactions involving tyrosine impart temperature- and concentration-dependent self-coacervation of the CTD. NMR spectroscopy, molecular ensemble calculations and all-atom molecular dynamics simulations demonstrate the presence of diverse tyrosine-engaging interactions, including tyrosine-proline contacts, in condensed states of human CTD and other low-complexity proteins. We further show that the network of multivalent interactions involving tyrosine is responsible for the co-recruitment of the human Mediator complex and CTD during phase separation. Our work advances the understanding of the driving forces of CTD phase separation and thus provides the basis to better understand CTD-mediated Pol II clustering in eukaryotic gene transcription.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2023-01-092023-09-102023-09-25
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: 15
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/s41467-023-41633-8
BibTex参照ID: flores-solis_driving_2023
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Communications
  省略形 : Nat. Commun.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London : Nature Publishing Group
ページ: - 巻号: 14 通巻号: 5979 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2041-1723
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2041-1723