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  Pretraining is All You Need: A Multi-Atlas Enhanced Transformer Framework for Autism Spectrum Disorder Classification

Mahler, L., Wang, Q., Steiglechner, J., Birk, F., Heczko, S., Scheffler, K., & Lohmann, G. (2023). Pretraining is All You Need: A Multi-Atlas Enhanced Transformer Framework for Autism Spectrum Disorder Classification. In A., Abdulkadir, D., Bathula, N., Dvornek, S., Govindarajan, M., Habes, V., Kumar, E., Leonardsen, T., Wolfers, & Y., Xiao (Eds.), Machine Learning in Clinical Neuroimaging: 6th International Workshop, MLCN 2023, Held in Conjunction with MICCAI 2023, Vancouver, BC, Canada, October 8, 2023 (pp. 123-132). Cham, Switzerland: Springer. doi:10.1007/978-3-031-44858-4_3.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-D054-9 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000D-D055-8
資料種別: 会議論文

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作成者

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 作成者:
Mahler, L1, 著者           
Wang, Q1, 著者                 
Steiglechner, J1, 著者           
Birk, F1, 著者                 
Heczko, S1, 著者           
Scheffler, K1, 著者                 
Lohmann, G1, 著者                 
所属:
1Department High-Field Magnetic Resonance, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_1497796              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Autism spectrum disorder (ASD) is a prevalent psychiatric condition characterized by atypical cognitive, emotional, and social patterns. Timely and accurate diagnosis is crucial for effective interventions and improved outcomes in individuals with ASD. In this study, we propose a novel Multi-Atlas Enhanced Transformer framework, METAFormer, ASD classification. Our framework utilizes resting-state functional magnetic resonance imaging data from the ABIDE I dataset, comprising 406 ASD and 476 typical control (TC) subjects. METAFormer employs a multi-atlas approach, where flattened connectivity matrices from the AAL, CC200, and DOS160 atlases serve as input to the transformer encoder. Notably, we demonstrate that self-supervised pretraining, involving the reconstruction of masked values from the input, significantly enhances classification performance without the need for additional or separate training data. Through stratified cross-validation, we evaluate the proposed framework and show that it surpasses state-of-the-art performance on the ABIDE I dataset, with an average accuracy of 83.7% and an AUC-score of 0.832. The code for our framework is available at github.com/Lugges991/METAFormer.

資料詳細

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言語:
 日付: 2023-102023
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1007/978-3-031-44858-4_3
 学位: -

関連イベント

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イベント名: 6th International Workshop on Machine Learning in Clinical Neuroimaging (MLCN 2023)
開催地: Vancouver, BC, Canada
開始日・終了日: 2023-10-08

訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Machine Learning in Clinical Neuroimaging: 6th International Workshop, MLCN 2023, Held in Conjunction with MICCAI 2023, Vancouver, BC, Canada, October 8, 2023
種別: 会議論文集
 著者・編者:
Abdulkadir, A, 編集者
Bathula, DR, 編集者
Dvornek, NC, 編集者
Govindarajan, ST, 編集者
Habes, M, 編集者
Kumar, V1, 編集者                 
Leonardsen, E, 編集者
Wolfers, T, 編集者
Xiao, Y, 編集者
所属:
1 Department High-Field Magnetic Resonance, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max Planck Society, ou_1497796            
出版社, 出版地: Cham, Switzerland : Springer
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: 123 - 132 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISBN: 978-3-031-44857-7
DOI: 10.1007/978-3-031-44858-4

出版物 2

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出版物名: Lecture Notes in Computer Science
  その他 : Lect. Notes Comput. Sci.
種別: 連載記事
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Berlin : Springer
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0302-9743
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954928560451