日本語
 
Help Privacy Policy ポリシー/免責事項
  詳細検索ブラウズ

アイテム詳細

登録内容を編集ファイル形式で保存
一時保存へ追加
 タグ情報を表示リリース履歴を表示詳細要約
  Guiding the choice of informatics software and tools for lipidomics research applications.

Ni, Z., Wölk, M., Jukes, G., Espinosa, K. M., Ahrends, R., Aimo, L., Alvarez-Jarreta, J., Andrews, S., Andrews, R., Bridge, A., Clair, G. C., Conroy, M. J., Fahy, E., Gaud, C., Goracci, L., Hartler, J., Hoffmann, N., Kopczyinki, D., Korf, A., Lopez-Clavijo, A. F., Malik, A., Ackerman, J. M., Molenaar, M. R., O'Donovan, C., Pluskal, T., Shevchenko, A., Slenter, D., Siuzdak, G., Kutmon, M., Tsugawa, H., Willighagen, E. L., Xia, J., O'Donnell, V. B., & Fedorova, M. (2023). Guiding the choice of informatics software and tools for lipidomics research applications. Nature methods, 20(2), 193-204. doi:10.1038/s41592-022-01710-0.

Item is

 

表示: 全項目 非表示: 全項目

基本情報

表示: 非表示:
アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-AAF0-3 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-AAF1-2
資料種別: 学術論文

ファイル

表示: ファイル

関連URL

表示:

作成者

表示:
非表示:
 作成者:
Ni, Zuyao, 著者
Wölk, Michele, 著者
Jukes, Geoff, 著者
Espinosa, Karla Mendivelso, 著者
Ahrends, R, 著者
Aimo, Lucila, 著者
Alvarez-Jarreta, Jorge, 著者
Andrews, Simon, 著者
Andrews, Robert, 著者
Bridge, Alan, 著者
Clair, Geremy C, 著者
Conroy, Matthew J, 著者
Fahy, Eoin, 著者
Gaud, Caroline, 著者
Goracci, Laura, 著者
Hartler, Jürgen, 著者
Hoffmann, Nils, 著者
Kopczyinki, Dominik, 著者
Korf, Ansgar, 著者
Lopez-Clavijo, Andrea F, 著者
Malik, Adnan, 著者Ackerman, Jacobo Miranda, 著者Molenaar, Martijn R, 著者O'Donovan, Claire, 著者Pluskal, Tomás, 著者Shevchenko, Andrej1, 著者           Slenter, Denise, 著者Siuzdak, Gary, 著者Kutmon, Martina, 著者Tsugawa, Hiroshi, 著者Willighagen, Egon L, 著者Xia, Jianguo, 著者O'Donnell, Valerie B, 著者Fedorova, Maria, 著者 全て表示
所属:
1Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Max Planck Society, ou_2340692              

内容説明

表示:
非表示:
キーワード: -
 要旨: Progress in mass spectrometry lipidomics has led to a rapid proliferation of studies across biology and biomedicine. These generate extremely large raw datasets requiring sophisticated solutions to support automated data processing. To address this, numerous software tools have been developed and tailored for specific tasks. However, for researchers, deciding which approach best suits their application relies on ad hoc testing, which is inefficient and time consuming. Here we first review the data processing pipeline, summarizing the scope of available tools. Next, to support researchers, LIPID MAPS provides an interactive online portal listing open-access tools with a graphical user interface. This guides users towards appropriate solutions within major areas in data processing, including (1) lipid-oriented databases, (2) mass spectrometry data repositories, (3) analysis of targeted lipidomics datasets, (4) lipid identification and (5) quantification from untargeted lipidomics datasets, (6) statistical analysis and visualization, and (7) data integration solutions. Detailed descriptions of functions and requirements are provided to guide customized data analysis workflows.

資料詳細

表示:
非表示:
言語:
 日付: 2023-02-01
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/s41592-022-01710-0
その他: cbg-8492
PMID: 36543939
 学位: -

関連イベント

表示:

訴訟

表示:

Project information

表示:

出版物 1

表示:
非表示:
出版物名: Nature methods
  その他 : Nat Methods
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 20 (2) 通巻号: - 開始・終了ページ: 193 - 204 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: -