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  Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors.

Beydag-Tasöz, B. S., D'Costa, J. V., Hersemann, L., Lee, B. H., Luppino, F., Kim, Y. H., Zechner, C., & Grapin-Botton, A. (2023). Integrating single-cell imaging and RNA sequencing datasets links differentiation and morphogenetic dynamics of human pancreatic endocrine progenitors. Developmental cell, 58(21), 2292-2308. doi:10.1016/j.devcel.2023.07.019.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-AB00-1 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000E-AB01-0
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Beydag-Tasöz, Belin Selcen1, 著者           
D'Costa, Joyson Verner, 著者
Hersemann, Lena, 著者
Lee, Byung Ho, 著者
Luppino, Federica1, 著者           
Kim, Yung Hae1, 著者           
Zechner, Christoph1, 著者           
Grapin-Botton, Anne1, 著者           
所属:
1Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Max Planck Society, ou_2340692              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Basic helix-loop-helix genes, particularly proneural genes, are well-described triggers of cell differentiation, yet information on their dynamics is limited, notably in human development. Here, we focus on Neurogenin 3 (NEUROG3), which is crucial for pancreatic endocrine lineage initiation. By monitoring both NEUROG3 gene expression and protein in single cells using a knockin dual reporter in 2D and 3D models of human pancreas development, we show an approximately 2-fold slower expression of human NEUROG3 than that of the mouse. We observe heterogeneous peak levels of NEUROG3 expression and reveal through long-term live imaging that both low and high NEUROG3 peak levels can trigger differentiation into hormone-expressing cells. Based on fluorescence intensity, we statistically integrate single-cell transcriptome with dynamic behaviors of live cells and propose a data-mapping methodology applicable to other contexts. Using this methodology, we identify a role for KLK12 in motility at the onset of NEUROG3 expression.

資料詳細

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 日付: 2023-11-06
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1016/j.devcel.2023.07.019
その他: cbg-8607
PMID: 37591246
 学位: -

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訴訟

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出版物 1

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出版物名: Developmental cell
  その他 : Dev Cell
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 58 (21) 通巻号: - 開始・終了ページ: 2292 - 2308 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): -