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  Revealing reaction intermediates in one-carbon elongation ThDP/CoA dependent enzyme family

Joachimiak, A., Kim, Y., Lee, S. H., Gade, P., Nattermann, M., Maltseva, N., Endres, M., Chen, J., Wichmann, P., Hu, Y., Marchal, D. G., Yoshikuni, Y., Erb, T. J., Gonzalez, R., & Michalska, K. (2024). Revealing reaction intermediates in one-carbon elongation ThDP/CoA dependent enzyme family. Research Square.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000F-26EA-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000F-26EB-E
資料種別: Preprint

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作成者

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 作成者:
Joachimiak, Andrzej1, 著者
Kim, Youngchang1, 著者
Lee, Seung Hwan1, 著者
Gade, Priyanka1, 著者
Nattermann, Maren2, 著者           
Maltseva, Natalia1, 著者
Endres, Michael1, 著者
Chen, Jing1, 著者
Wichmann, Philipp2, 著者           
Hu, Yang1, 著者
Marchal, Daniel G.2, 著者           
Yoshikuni, Yasuo1, 著者
Erb, Tobias J.2, 著者                 
Gonzalez, Ramon1, 著者
Michalska, Karolina1, 著者
所属:
1external, ou_persistent22              
2Understanding and Building Metabolism, Department of Biochemistry and Synthetic Metabolism, Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Max Planck Society, ou_3266303              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: <p>2-Hydroxyacyl-CoA lyase/synthase (HACL/S) is a thiamine diphosphate (ThDP)-dependent versatile enzyme originally discovered in the mammalian α-oxidation pathway. HACL/S natively cleaves 2-hydroxyacyl-CoAs and, in its reverse direction, condenses formyl-CoA with aldehydes or ketones. The one-carbon elongation biochemistry based on HACL/S has enabled the use of molecules derived from greenhouse gases as biomanufacturing feedstocks. We investigated several HACL/S family members with high activity in the condensation of formyl-CoA and aldehydes, and distinct chain-length specificities and kinetic parameters. Our analysis revealed the structures of enzymes in complex with acyl-CoA substrates and products, several covalent transition states, bound ThDP and ADP, as well as a previously unseen C-terminal active site region. One of these new states corresponds to the intermediary α-carbanion with ThDP covalently attached to formyl- CoA. This research distinguishes HACL/S from related sub-families and identifies key residues involved in substrate binding and catalysis. These findings expand our knowledge of acyloincondensation biochemistry and offer new prospects for biocatalysis using carbon elongation.</p>

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2024-03-24
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読なし
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Research Square
  省略形 : Res Sq
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2693-5015
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2693-5015