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  longmixr: a tool for robust clustering of high-dimensional cross-sectional and longitudinal variables of mixed data types

Hagenberg, J., Budde, M., Pandeva, T., Kondofersky, I., Theis, F. J., Schaupp, S. K., et al. (2024). longmixr: a tool for robust clustering of high-dimensional cross-sectional and longitudinal variables of mixed data types. BIOINFORMATICS, 40(4): btae137. doi:10.1093/bioinformatics/btae137.

Item is

Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Hagenberg, Jonas1, 2, Autor           
Budde, Monika, Autor
Pandeva, Teodora, Autor
Kondofersky, Ivan, Autor
Theis, Fabian J., Autor
Schaupp, Sabrina K., Autor
Schulze, Thomas G., Autor
Mueller, Nikola S., Autor
Heilbronner, Urs, Autor
Batra, Richa, Autor
Knauer-Arloth, Janine1, Autor           
Affiliations:
1Dept. Genes and Environment, Max Planck Institute of Psychiatry, Max Planck Society, ou_2035295              
2IMPRS Translational Psychiatry, Max Planck Institute of Psychiatry, Max Planck Society, ou_3318616              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: The Summary Accurate clustering of mixed data, encompassing binary, categorical, and continuous variables, is vital for effective patient stratification in clinical questionnaire analysis. To address this need, we present longmixr, a comprehensive R package providing a robust framework for clustering mixed longitudinal data using finite mixture modeling techniques. By incorporating consensus clustering, longmixr ensures reliable and stable clustering results. Moreover, the package includes a detailed vignette that facilitates cluster exploration and visualization.
Availability and implementation The R package is freely available at https://cran.r-project.org/package=longmixr with detailed documentation, including a case vignette, at https://cellmapslab.github.io/longmixr/.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2024
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: 001196653200003
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae137
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: BIOINFORMATICS
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 40 (4) Artikelnummer: btae137 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1367-4803