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  Preparation of Linked-Read Sequencing Libraries using Haplotagging beads

Kucka, M., & Chan, Y. (2024). Preparation of Linked-Read Sequencing Libraries using Haplotagging beads. Springer Protocols. doi:10.17504/protocols.io.5jyl827m8l2w/v1.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000F-E3AD-E 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000F-E3AE-D
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Kucka, M1, 著者                 
Chan, YF1, 著者                 
所属:
1Chan Group, Friedrich Miescher Laboratory, Max Planck Society, ou_3008688              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Haplotagging beads are prepared in form of a 96 well plate where each well contains M280-Streptavidin beads linked with complete and barcoded i5 and i7 Tn5-sequencing adapters. Each well contains 884736 well-specific and barcoded Tn5-adapters assembled with Tn5 transposase. Whole plate then has almost 85 million barcodes (96 x 884736 = 84934656 barcodes), with each bead carrying many copies of a single segmented barcode.
The haplotagging beads are used to prepare short-read linked-read sequencing libraries with both i7 and i5 index being 13bp long. High molecule DNA is tagmented with a single bead and all the reads of that DNA molecule will carry the same barcode combination (one of 85 million).

資料詳細

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言語:
 日付: 2024-09
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.17504/protocols.io.5jyl827m8l2w/v1
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Springer Protocols
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Berlin, Germany : Springer
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2478541-6