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  Rise and SINE: Roles of transcription factors and retrotransposons in zygotic genome activation

Kravchenko, P., & Tachibana, K. (2025). Rise and SINE: Roles of transcription factors and retrotransposons in zygotic genome activation. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 26(1), 68-79. doi:10.1038/s41580-024-00772-6.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000F-EDDC-F 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-5E61-8
資料種別: 学術論文

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Kravchenko_Tachibana_submitted_version.pdf (全文テキスト(全般)), 766KB
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https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-5D84-1
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Kravchenko_Tachibana_submitted_version.pdf
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Kravchenko_Sup_Table_1.xlsx (全文テキスト(全般)), 290KB
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https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-5D86-F
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作成者

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 作成者:
Kravchenko, Pavel1, 著者           
Tachibana, Kikue1, 著者           
所属:
1Tachibana, Kikuë / Totipotency, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_3224113              

内容説明

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キーワード: EARLY MOUSE DEVELOPMENT; GENE-EXPRESSION; DNA METHYLATION; CHROMATIN ACCESSIBILITY; EMBRYOS; BINDING; TRANSITION; 1ST; REPLICATION; FAMILYCell Biology;
 要旨: In sexually reproducing organisms, life begins with the fusion of transcriptionally silent gametes, the oocyte and sperm. Although initiation of transcription in the embryo, known as zygotic genome activation (ZGA), is universally required for development, the transcription factors regulating this process are poorly conserved. In this Perspective, we discuss recent insights into the mechanisms of ZGA in totipotent mammalian embryos, namely ZGA regulation by several transcription factors, including by orphan nuclear receptors (OrphNRs) such as the pioneer transcription factor NR5A2, and by factors of the DUX, TPRX and OBOX families. We performed a meta-analysis and compiled a list of pan-ZGA genes, and found that most of these genes are indeed targets of the above transcription factors. Remarkably, more than a third of these ZGA genes appear to be regulated both by OrphNRs such as NR5A2 and by OBOX proteins, whose motifs co-occur in SINE B1 retrotransposable elements, which are enriched near ZGA genes. We propose that ZGA in mice is activated by recruitment of multiple transcription factors to SINE B1 elements that function as enhancers, and discuss a potential relevance of this mechanism to Alu retrotransposable elements in human ZGA.
Although zygotic genome activation (ZGA) is universally required for development, the responsible transcription factors are poorly conserved. In mammalian totipotent embryos, (pioneer) transcription factors of two families co-regulate many ZGA genes by binding to nearby SINE retrotransposons, which thus function as their enhancers.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2025-01-01
 出版の状態: 出版
 ページ: 12
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): ISI: 001324509900001
DOI: 10.1038/s41580-024-00772-6
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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Project name : ERC-CoG-818556 TotipotentZygotChrom
Grant ID : -
Funding program : European Research Council grant
Funding organization : European Research Council

出版物 1

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出版物名: Nature Reviews Molecular Cell Biology
  省略形 : Nat Rev Mol Cell Biol
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: London, UK : Nature Pub. Group
ページ: - 巻号: 26 (1) 通巻号: - 開始・終了ページ: 68 - 79 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 1471-0072
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/110985821000941