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  The chromatin remodeler CHD3 is highly expressed in mature neurons and regulates genes involved in synaptic development and function

Den Hoed, J., Wong, M. M. K., Claassen, W., De Hoyos, L., Lütje, L., Heide, M., Huttner, W. B., & Fisher, S. E. (2024). The chromatin remodeler CHD3 is highly expressed in mature neurons and regulates genes involved in synaptic development and function. bioRxiv. doi:10.1101/2024.04.29.591720.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-4859-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-485A-9
資料種別: Preprint

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:
DenHoed_etal_2024_preprint_chromatin remodeler CHD3 is....pdf (プレプリント), 9MB
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https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-485B-8
ファイル名:
DenHoed_etal_2024_preprint_chromatin remodeler CHD3 is....pdf
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技術的なメタデータ:
著作権日付:
2024
著作権情報:
The copyright holder for this preprint is the author/funder, who has granted bioRxiv a license to display the preprint in perpetuity. It is made available under a CC-BY 4.0 International license.
:
denHoed_etal_2024suppl1_preprint_chromatin remodeler CHD3 is....pdf (付録資料), 24MB
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https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-485C-7
ファイル名:
supplementary figures
説明:
-
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Green
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技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
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-
CCライセンス:
-
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denHoed_etal_2024suppl2_preprint_chromatin remodeler CHD3 is....xlsx (付録資料), 2MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0010-485D-6
ファイル名:
supplementary tables
説明:
-
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application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet / [MD5]
技術的なメタデータ:
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-

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作成者

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 作成者:
Den Hoed, Joery1, 著者           
Wong, Maggie M. K.1, 著者           
Claassen, Willemijn1, 著者           
De Hoyos, Lucía1, 2, 3, 著者           
Lütje, Lukas1, 著者           
Heide, Michael, 著者
Huttner, Wieland B., 著者
Fisher, Simon E.1, 4, 著者           
所属:
1Language and Genetics Department, MPI for Psycholinguistics, Max Planck Society, ou_792549              
2International Max Planck Research School for Language Sciences, MPI for Psycholinguistics, Max Planck Society, Nijmegen, NL, ou_1119545              
3Population genetics of human communication, MPI for Psycholinguistics, Max Planck Society, ou_2579694              
4Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour, External Organizations, ou_55236              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Changes in the dynamics of chromatin state that control spatiotemporal gene expression patterns are crucial during brain development. CHD3 is a chromatin remodeler that is highly expressed during neurogenesis and that functions as a core member of the NuRD complex, a large multiprotein complex mediating chromatin state. Genetic disruptions in CHD3 have been implicated in a neurodevelopmental disorder characterized by intellectual disability, macrocephaly and severe speech deficits. To study the roles of CHD3 during early human brain development, we generated induced pluripotent stem cells with heterozygous and homozygous loss-of-function mutations, differentiated them into unguided neural organoids and cortical neurons, and analyzed these by immunohistochemistry, bulk RNA-, single-cell RNA-, and ChIP-sequencing. Loss of CHD3 expression had no detectable effects on early neuroepithelium formation and organoid growth, nor did it significantly affect cell type composition or neuronal differentiation speed. Instead, upon loss of CHD3, we observed dysregulation of genes related to axon guidance and synapse development across all datasets, identifying a novel role for the protein as a regulator that facilitates neurogenesis, in particular neuronal maturation. Our results based on genetically engineered knockout organoids pave the way for future studies modeling the neurobiological pathways affected in CHD3-related disorder.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2024-04-29
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読なし
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1101/2024.04.29.591720
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: bioRxiv
  省略形 : bioRxiv
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: - 通巻号: - 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ZDB: 2766415-6
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2766415-6