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 詳細要約
  Meta-analysis and imputation refines the association of 15q25 with smoking quantity

Liu, J. Z., Tozzi, F., Waterworth, D. M., Pillai, S. G., Muglia, P., Middleton, L., Berrettini, W., Knouff, C. W., Yuan, X., Waeber, G., Vollenweider, P., Preisig, M., Wareham, N. J., Zhao, J. H., Loos, R. J. F., Barroso, I., Khaw, K.-T., Grundy, S., Barter, P., Mahley, R., Kesaniemi, A., McPherson, R., Vincent, J. B., Strauss, J., Kennedy, J. L., Farmer, A., McGuffin, P., Day, R., Matthews, K., Bakke, P., Gulsvik, A., Lucae, S., Ising, M., Brueckl, T., Horstmann, S., Wichmann–, H.-E., Rawal, R., Dahmen, N., Lamina, C., Polasek, O., Zgaga, L., Huffman, J., Campbell, S., Kooner, J., Chambers, J. C., Burnett, M. S., Devaney, J. M., Pichard, A. D., Kent, K. M., Satler, L., Lindsay, J. M., Waksman, R., Epstein, S., Wilson, J. F., Wild, S. H., Campbell, H., Vitart, V., Reilly, M. P., Li, M., Qu, L., Wilensky, R., Matthai, W., Hakonarson, H. H., Rader, D. J., Franke, A., Wittig, M., Schäfer, A., Uda, M., Terracciano, A., Xiao, X., Busonero, F., Scheet, P., Schlessinger, D., St. Clair, D., Rujescu, D., Abecasis, G. R., Grabe, H. J., Teumer, A., Völzke, H., Petersmann, A., John, U., Rudan, I., Hayward, C., Wright, A. F., Kolcic, I., Wright, B. J., Thompson, J. R., Balmforth, A. J., Hall, A. S., Samani, N. J., Anderson, C. A., Ahmad, T., Mathew, C. G., Parkes, M., Satsangi, J., Caulfield, M., Munroe, P. B., Farrall, M., Dominiczak, A., Worthington, J., Thomson, W., Eyre, S., Barton, A., Mooser, V., Francks, C., & Marchini, J. (2010). Meta-analysis and imputation refines the association of 15q25 with smoking quantity. Nature Genetics, 42(5), 436-440. doi:10.1038/ng.572.

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0012-C912-8 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0012-C918-B
資料種別: 学術論文

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Liu_Meta_analysis_Nature_Genetics_2009.pdf (出版社版), 709KB
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https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0012-C911-A
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Liu_Meta_analysis_Nature_Genetics_2009.pdf
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作成者

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 作成者:
Liu, Jason Z., 著者
Tozzi, Federica, 著者
Waterworth, Dawn M., 著者
Pillai, Sreekumar G., 著者
Muglia, Pierandrea, 著者
Middleton, Lefkos, 著者
Berrettini, Wade, 著者
Knouff, Christopher W., 著者
Yuan, Xin, 著者
Waeber, Gérard, 著者
Vollenweider, Peter, 著者
Preisig, Martin, 著者
Wareham, Nicholas J., 著者
Zhao, Jing Hua, 著者
Loos, Ruth J. F., 著者
Barroso, Inês, 著者
Khaw, Kay-Tee, 著者
Grundy, Scott, 著者
Barter, Philip, 著者
Mahley, Robert, 著者
Kesaniemi, Antero, 著者McPherson, Ruth, 著者Vincent, John B., 著者Strauss, John, 著者Kennedy, James L., 著者Farmer, Anne, 著者McGuffin, Peter, 著者Day, Richard, 著者Matthews, Keith, 著者Bakke, Per, 著者Gulsvik, Amund, 著者Lucae, Susanne, 著者Ising, Marcus, 著者Brueckl, Tanja, 著者Horstmann, Sonja, 著者Wichmann–, H-Erich, 著者Rawal, Rajesh, 著者Dahmen, Norbert, 著者Lamina, Claudia, 著者Polasek, Ozren, 著者Zgaga, Lina, 著者Huffman, Jennifer, 著者Campbell, Susan, 著者Kooner, Jaspal, 著者Chambers, John C., 著者Burnett, Mary Susan, 著者Devaney, Joseph M., 著者Pichard, Augusto D., 著者Kent, Kenneth M., 著者Satler, Lowell, 著者Lindsay, Joseph M., 著者Waksman, Ron, 著者Epstein, Stephen, 著者Wilson, James F., 著者Wild, Sarah H., 著者Campbell, Harry, 著者Vitart, Veronique, 著者Reilly, Muredach P., 著者Li, Mingyao, 著者Qu, Liming, 著者Wilensky, Robert, 著者Matthai, William, 著者Hakonarson, Hakon H., 著者Rader, Daniel J., 著者Franke, Andre, 著者Wittig, Michael, 著者Schäfer, Arne, 著者Uda, Manuela, 著者Terracciano, Antonio, 著者Xiao, Xiangjun, 著者Busonero, Fabio, 著者Scheet, Paul, 著者Schlessinger, David, 著者St. Clair, David , 著者Rujescu, Dan, 著者Abecasis, Gonçalo R., 著者Grabe, Hans Jörgen, 著者Teumer, Alexander, 著者Völzke, Henry, 著者Petersmann, Astrid, 著者John, Ulrich, 著者Rudan, Igor, 著者Hayward, Caroline, 著者Wright, Alan F., 著者Kolcic, Ivana, 著者Wright, Benjamin J., 著者Thompson, John R., 著者Balmforth, Anthony J., 著者Hall, Alistair S., 著者Samani, Nilesh J., 著者Anderson, Carl A., 著者Ahmad, Tariq, 著者Mathew, Christopher G., 著者Parkes, Miles, 著者Satsangi, Jack, 著者Caulfield, Mark, 著者Munroe, Patricia B., 著者Farrall, Martin, 著者Dominiczak, Anna, 著者Worthington, Jane, 著者Thomson, Wendy, 著者Eyre, Steve, 著者Barton, Anne, 著者Mooser, Vincent, 著者Francks, Clyde1, 2, 著者           Marchini, Jonathan, 著者 全て表示
所属:
1Genetics Division, GlaxoSmithKline, Verona, Italy., ou_persistent22              
2Language and Genetics Group, MPI for Psycholinguistics, Max Planck Society, Nijmegen, NL, ou_55213              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Smoking is a leading global cause of disease and mortality. We established the Oxford-GlaxoSmithKline study (Ox-GSK) to perform a genome-wide meta-analysis of SNP association with smoking-related behavioral traits. Our final data set included 41,150 individuals drawn from 20 disease, population and control cohorts. Our analysis confirmed an effect on smoking quantity at a locus on 15q25 (P = 9.45 x 10(-19)) that includes CHRNA5, CHRNA3 and CHRNB4, three genes encoding neuronal nicotinic acetylcholine receptor subunits. We used data from the 1000 Genomes project to investigate the region using imputation, which allowed for analysis of virtually all common SNPs in the region and offered a fivefold increase in marker density over HapMap2 (ref. 2) as an imputation reference panel. Our fine-mapping approach identified a SNP showing the highest significance, rs55853698, located within the promoter region of CHRNA5. Conditional analysis also identified a secondary locus (rs6495308) in CHRNA3.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2010
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子（DOI, ISBNなど）: DOI: 10.1038/ng.572
PMID: 20418889
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Nature Genetics
  その他 : Nature Genet.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: New York, NY : Nature America, Inc.
ページ: - 巻号: 42 (5) 通巻号: - 開始・終了ページ: 436 - 440 識別子（ISBN, ISSN, DOIなど）: その他: 954925598609
その他: 1061-4036
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925598609