AGEpy: a Python package for computational biology

Metge, F.; Sehlke, R.; Boucas, J.

doi:10.1101/450890

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Zeitschriftenartikel

AGEpy: a Python package for computational biology

MPG-Autoren

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Metge, F.
Bioinformatics, Core Facilities, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Max Planck Society;

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Sehlke, R.
Department Partridge - Biological Mechanisms of Ageing, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Max Planck Society;

/persons/resource/persons281221

Boucas, J.
Bioinformatics, Core Facilities, Max Planck Institute for Biology of Ageing, Max Planck Society;

Externe Ressourcen

https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/10/24/450890.full.pdf
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Zitation

Metge, F., Sehlke, R., & Boucas, J. (2018). AGEpy: a Python package for computational biology. bioRxiv, 450890. doi:10.1101/450890.

Zitierlink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000B-44B0-1

Zusammenfassung

Summary: AGEpy is a Python package focused on the transformation of interpretable data into biological meaning. It is designed to support high-throughput analysis of pre-processed biological data using either local Python based processing or Python based API calls to local or remote servers. In this application note we describe its different Python modules as well as its command line accessible tools aDiff, abed, blasto, david, and obo2tsv.Availability: The open source AGEpy Python package is freely available at: https://github.com/mpg-age-bioinformatics/AGEpy.Contact: jorge.boucas{at}age.mpg.de